More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1427 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1427  DNA primase  100 
 
 		 602 aa  1249    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  61.42 
 
 		 603 aa  765    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  42.48 
 
 		 637 aa  490  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  41.96 
 
 		 621 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.18 
 
 		 613 aa  320  3e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  36.73 
 
 		 599 aa  314  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  37.06 
 
 		 601 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  37.6 
 
 		 598 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  39.38 
 
 		 606 aa  301  3e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  38.39 
 
 		 605 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  38.39 
 
 		 605 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.87 
 
 		 598 aa  297  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.87 
 
 		 598 aa  296  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.87 
 
 		 598 aa  296  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.87 
 
 		 598 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.87 
 
 		 598 aa  296  7e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.87 
 
 		 598 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.48 
 
 		 571 aa  293  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  38.55 
 
 		 598 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.73 
 
 		 600 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  39.9 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  38.32 
 
 		 598 aa  291  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.14 
 
 		 598 aa  290  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  37.29 
 
 		 619 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  36.6 
 
 		 593 aa  276  8e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  37.1 
 
 		 601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  33.13 
 
 		 601 aa  274  4.0000000000000004e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.74 
 
 		 600 aa  270  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.27 
 
 		 595 aa  269  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  31.24 
 
 		 626 aa  267  5e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  38.42 
 
 		 599 aa  267  5e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  33.68 
 
 		 640 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  36 
 
 		 605 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0995  DNA primase  32.43 
 
 		 610 aa  265  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.92 
 
 		 614 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  31.7 
 
 		 605 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  35.97 
 
 		 604 aa  259  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  30.58 
 
 		 652 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  30.32 
 
 		 651 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  39.31 
 
 		 596 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  31.25 
 
 		 617 aa  253  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  35.5 
 
 		 655 aa  253  8.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  30.27 
 
 		 588 aa  252  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  35.8 
 
 		 576 aa  252  1e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  33.02 
 
 		 663 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  33.87 
 
 		 660 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  30.38 
 
 		 638 aa  252  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  33.81 
 
 		 584 aa  252  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  37.8 
 
 		 676 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  35.09 
 
 		 660 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  36.71 
 
 		 577 aa  251  3e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  33.99 
 
 		 663 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  33.87 
 
 		 660 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  38.1 
 
 		 565 aa  250  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  31.53 
 
 		 582 aa  250  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  36.54 
 
 		 604 aa  250  7e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  33.74 
 
 		 655 aa  250  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  36.44 
 
 		 626 aa  250  7e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  31.89 
 
 		 583 aa  249  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  33.64 
 
 		 660 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  33.41 
 
 		 664 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.36 
 
 		 599 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  33.64 
 
 		 660 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  35.04 
 
 		 575 aa  247  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  33.57 
 
 		 662 aa  248  3e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  35.77 
 
 		 645 aa  247  4e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  33.57 
 
 		 640 aa  247  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  34.57 
 
 		 618 aa  247  4e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  37.33 
 
 		 656 aa  246  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  32.25 
 
 		 625 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  36.78 
 
 		 544 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  31.5 
 
 		 694 aa  244  3.9999999999999997e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  32.55 
 
 		 674 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  35.7 
 
 		 595 aa  244  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  35.44 
 
 		 595 aa  243  9e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 604 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  31.57 
 
 		 686 aa  242  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  35.31 
 
 		 601 aa  242  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  37.05 
 
 		 587 aa  243  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  36.47 
 
 		 611 aa  241  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  32.28 
 
 		 652 aa  241  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  33.26 
 
 		 682 aa  241  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  35.88 
 
 		 675 aa  241  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  36.54 
 
 		 598 aa  240  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  35.92 
 
 		 660 aa  241  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  34.66 
 
 		 657 aa  240  5e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  32.91 
 
 		 636 aa  239  6.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  35.7 
 
 		 574 aa  239  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  33.79 
 
 		 634 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  36.26 
 
 		 573 aa  239  8e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  31.75 
 
 		 583 aa  239  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  30.8 
 
 		 588 aa  239  9e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  34.99 
 
 		 613 aa  239  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  32.43 
 
 		 666 aa  239  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  34.85 
 
 		 623 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  34.64 
 
 		 574 aa  238  2e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  31.5 
 
 		 640 aa  238  3e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  33.64 
 
 		 679 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  30.06 
 
 		 653 aa  238  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  35.43 
 
 		 574 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>