More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0843 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0843  ABC transporter component  100 
 
 		 577 aa  1125    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00459321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09300  putative ATP-binding component of ABC transporter  65.45 
 
 		 570 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00251993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0877  ABC transporter ATP-binding protein  65.79 
 
 		 570 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0214075  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0675  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  51.47 
 
 		 573 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.018058  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1825  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  50.69 
 
 		 576 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2153  putative ATP-binding component of ABC transporter  50.6 
 
 		 575 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356236  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0790  putative ABC transporter, permease protein  50.78 
 
 		 575 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3372  ABC transporter related  50.94 
 
 		 574 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0307564  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0880  putative ABC transporter, permease protein  50.78 
 
 		 575 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4995  ABC transporter related  50.94 
 
 		 574 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.147401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5292  ABC transporter related  51.05 
 
 		 574 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.332078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  36.24 
 
 		 606 aa  307  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.97 
 
 		 612 aa  306  8.000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  35.23 
 
 		 611 aa  284  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  32.69 
 
 		 597 aa  263  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.7 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  37.77 
 
 		 619 aa  251  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  29.48 
 
 		 590 aa  243  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  36.65 
 
 		 596 aa  240  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  31.69 
 
 		 603 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  33.91 
 
 		 597 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  33.27 
 
 		 598 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.23 
 
 		 573 aa  220  3.9999999999999997e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  33.11 
 
 		 608 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  30.89 
 
 		 600 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  28.01 
 
 		 575 aa  213  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.73 
 
 		 581 aa  211  2e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  30.74 
 
 		 768 aa  212  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  34.82 
 
 		 581 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  31.19 
 
 		 640 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 		 618 aa  211  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  31.74 
 
 		 642 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  30.7 
 
 		 578 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  31.69 
 
 		 603 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  27.5 
 
 		 592 aa  207  4e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  32.76 
 
 		 600 aa  207  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  29.79 
 
 		 1194 aa  207  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  29.13 
 
 		 584 aa  207  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  30.12 
 
 		 624 aa  206  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  27.42 
 
 		 580 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  29.61 
 
 		 638 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  26.72 
 
 		 566 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  28.49 
 
 		 604 aa  203  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0754  ABC transporter, ATP-binding protein  29.49 
 
 		 596 aa  203  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  30.51 
 
 		 659 aa  203  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  27.69 
 
 		 566 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  30.63 
 
 		 611 aa  203  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.3 
 
 		 588 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.08 
 
 		 596 aa  202  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  31.13 
 
 		 576 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  29.09 
 
 		 596 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  31.5 
 
 		 593 aa  201  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  32.5 
 
 		 658 aa  201  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  30.67 
 
 		 663 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.78 
 
 		 597 aa  201  3.9999999999999996e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  30.06 
 
 		 568 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  30.47 
 
 		 611 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  29.32 
 
 		 584 aa  201  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  27.86 
 
 		 576 aa  200  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.39 
 
 		 1091 aa  200  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  30.15 
 
 		 594 aa  200  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2098  ABC transporter related  43.64 
 
 		 609 aa  200  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  30.92 
 
 		 585 aa  200  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  30.1 
 
 		 610 aa  200  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  31.38 
 
 		 609 aa  200  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1330  ABC transporter related  37.58 
 
 		 571 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.987639  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.09 
 
 		 595 aa  199  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  30.69 
 
 		 585 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.12 
 
 		 605 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  27.07 
 
 		 572 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  32.26 
 
 		 582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  29.32 
 
 		 594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  29.32 
 
 		 596 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  33.13 
 
 		 607 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.5 
 
 		 571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  25.38 
 
 		 599 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.63 
 
 		 571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  28.21 
 
 		 572 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  29.15 
 
 		 598 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  31.98 
 
 		 614 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  32.26 
 
 		 582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  28.12 
 
 		 588 aa  198  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  26.63 
 
 		 571 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  27.59 
 
 		 638 aa  197  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.63 
 
 		 571 aa  197  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.35 
 
 		 585 aa  198  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  30.02 
 
 		 582 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  31.44 
 
 		 597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  33.65 
 
 		 611 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.99 
 
 		 589 aa  197  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  32.34 
 
 		 596 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.74 
 
 		 622 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3644  ABC transporter related  30.43 
 
 		 598 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00219538  normal  0.175783 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1337  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.17 
 
 		 589 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.63 
 
 		 571 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.63 
 
 		 571 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  28.85 
 
 		 658 aa  197  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.63 
 
 		 571 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0803  ABC transporter related  30.43 
 
 		 598 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000452129  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0822  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.48 
 
 		 579 aa  197  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>