More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1666 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1666  ABC transporter related  100 
 
 		 353 aa  689    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  81.2 
 
 		 353 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  78.63 
 
 		 361 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5851  ABC transporter ATP-binding protein  74.71 
 
 		 351 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228594  normal  0.59498 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2149  ABC transporter related  57.43 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  0.266081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  53.62 
 
 		 352 aa  358  8e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1504  ABC transporter related  57.14 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2651  ABC transporter related  56.76 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220335  normal  0.549326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1465  ABC polyamine transporter, ATPase subunit  57.66 
 
 		 352 aa  349  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476678  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0750  ABC transporter related  54.17 
 
 		 343 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1231  ABC transporter related  54.17 
 
 		 343 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1205  ABC transporter related  54.17 
 
 		 343 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.226177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1114  ABC transporter related  53.87 
 
 		 343 aa  341  9e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0746662  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1415  ABC transporter related  55.36 
 
 		 353 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.742114  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1113  ABC transporter related  53.87 
 
 		 343 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2834  ABC transporter, ATP-binding protein  54.44 
 
 		 342 aa  340  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431844  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2077  ABC transporter related  54.68 
 
 		 343 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4340  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  54.71 
 
 		 343 aa  339  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1456  ABC transporter related  55.36 
 
 		 353 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0461545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1262  ABC transporter related  53.69 
 
 		 353 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0942202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1794  ABC transporter ATP-binding protein  54.93 
 
 		 359 aa  326  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  0.0198791 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4692  ABC transporter  52.49 
 
 		 343 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0489  ABC transporter, ATP-binding protein  52.33 
 
 		 347 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3315  ABC transporter related  51.79 
 
 		 342 aa  324  2e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0775191  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3076  ABC transporter, ATP-binding protein  55.89 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1540  ABC transporter, ATP-binding protein  55.89 
 
 		 342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1210  ABC transporter, ATP-binding protein  55.03 
 
 		 382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.451725  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1413  ABC transporter, ATP-binding protein  55.59 
 
 		 342 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.11782  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1406  ABC transporter, ATP-binding protein  55.59 
 
 		 342 aa  318  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0657  ABC transporter, ATP-binding protein  55.59 
 
 		 342 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.501106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0496  ABC transporter, ATP-binding protein  55.59 
 
 		 342 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3121  ABC transporter related  51.69 
 
 		 353 aa  318  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 		 370 aa  302  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.57 
 
 		 372 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3398  ABC transporter related  53.02 
 
 		 341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3457  ABC transporter-related protein  51 
 
 		 361 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3343  ABC transporter related protein  44.59 
 
 		 348 aa  279  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  46.37 
 
 		 349 aa  278  8e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1993  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.381301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.04 
 
 		 346 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5504  ABC transporter related  45.03 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5124  ABC transporter related  45.03 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  50.84 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5213  ABC transporter related  45.03 
 
 		 346 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  41.47 
 
 		 348 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  47.5 
 
 		 352 aa  276  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  41.74 
 
 		 350 aa  276  5e-73  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  48.52 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  46.88 
 
 		 353 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0889  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.49 
 
 		 348 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000209161  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.41 
 
 		 353 aa  272  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1365  ABC transporter related  47.01 
 
 		 337 aa  272  7e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  43.42 
 
 		 348 aa  272  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  47.81 
 
 		 353 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04840  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  46.37 
 
 		 363 aa  272  8.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6000  ABC transporter related  47.11 
 
 		 356 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.16 
 
 		 352 aa  271  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.6 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2487  ferric transporter ATP-binding subunit  41.86 
 
 		 353 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.362569  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4419  ABC transporter related  44.29 
 
 		 356 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  41.83 
 
 		 366 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1935  spermidine/putrescine transport ATP-binding protein pota  41.57 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.672597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.82 
 
 		 343 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.5 
 
 		 354 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2418  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.31 
 
 		 363 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.82 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  54.29 
 
 		 353 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3496  ABC transporter related  44.16 
 
 		 386 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149399  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1474  ABC transporter related protein  45.53 
 
 		 337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00799241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.6 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2223  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.52 
 
 		 349 aa  269  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  45.38 
 
 		 358 aa  270  4e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0750  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.67 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000146357  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.5 
 
 		 360 aa  268  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  45.2 
 
 		 343 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1364  ferric transporter ATP-binding subunit  41.74 
 
 		 349 aa  268  8.999999999999999e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.741319  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3954  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  51.1 
 
 		 381 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.320364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.21 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  50.35 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6838  putrescine ABC transporter ATP-binding protein  49.35 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.840617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  44.54 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0639  ferric transporter ATP-binding subunit  41.35 
 
 		 349 aa  267  2e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.104376  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1896  ABC transporter related  44.83 
 
 		 359 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0892333  normal  0.42443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1544  ABC transporter related  45.95 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0675386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  47.62 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  45.35 
 
 		 356 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.28 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.2 
 
 		 353 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  49.12 
 
 		 334 aa  266  5e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.94 
 
 		 348 aa  266  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000472739  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  48.2 
 
 		 348 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 		 327 aa  265  7e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.62 
 
 		 356 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  45.28 
 
 		 327 aa  265  7e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3136  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding protein component  46.15 
 
 		 363 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.87757  hitchhiker  0.00000324689 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2375  ABC transporter related protein  46.91 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2096  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.96 
 
 		 371 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0587102  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.51 
 
 		 345 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  40.87 
 
 		 349 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>