More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3508 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  90.82 
 
 		 331 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  67.89 
 
 		 353 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  67.89 
 
 		 328 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  67.1 
 
 		 330 aa  408  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  56.15 
 
 		 328 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  55.02 
 
 		 328 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  50.94 
 
 		 356 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  50.83 
 
 		 326 aa  321  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  52.13 
 
 		 325 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  45.98 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2981  hypothetical protein  51.32 
 
 		 322 aa  309  4e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2409  hypothetical protein  51.32 
 
 		 322 aa  309  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417331  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2023  hypothetical protein  49.06 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  49.01 
 
 		 322 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  47.27 
 
 		 332 aa  305  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  48.74 
 
 		 324 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  47.32 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  48.68 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  48.72 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4438  extra-cytoplasmic solute receptor  46.77 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000369974  normal  0.285012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  48.16 
 
 		 330 aa  298  6e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  47.52 
 
 		 334 aa  298  9e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  47.49 
 
 		 328 aa  297  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1715  hypothetical protein  47.27 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.786272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  48.22 
 
 		 325 aa  295  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3459  hypothetical protein  47.37 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.505499  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0902  hypothetical protein  45.97 
 
 		 320 aa  288  8e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0987  hypothetical protein  45.97 
 
 		 320 aa  288  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  47.02 
 
 		 322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.65 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  46.45 
 
 		 331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  47.5 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5118  hypothetical protein  45.37 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534032 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  47.71 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  48.36 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  48.36 
 
 		 321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  46.45 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  46.69 
 
 		 328 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  46.86 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  46 
 
 		 327 aa  278  7e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  46 
 
 		 325 aa  278  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  45.18 
 
 		 339 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  44.26 
 
 		 322 aa  275  7e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.44 
 
 		 344 aa  275  9e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  46.64 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  44.7 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  48.53 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  44.41 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  45.97 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  44.03 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  44.94 
 
 		 328 aa  271  9e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  45.25 
 
 		 321 aa  271  9e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2912  hypothetical protein  47.32 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  46.18 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  43.93 
 
 		 347 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  44.67 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  44.59 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  47.67 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0522  hypothetical protein  44.48 
 
 		 324 aa  269  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  44.67 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  45.97 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  43.08 
 
 		 328 aa  268  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  44.37 
 
 		 330 aa  268  8e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  45.14 
 
 		 326 aa  268  8e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  44.12 
 
 		 366 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  43.63 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  44.66 
 
 		 335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.08 
 
 		 349 aa  266  5e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  45.51 
 
 		 327 aa  266  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  47.32 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  44.82 
 
 		 323 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  42.31 
 
 		 312 aa  265  7e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  46.49 
 
 		 330 aa  265  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0879  hypothetical protein  45.1 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381567 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  42.68 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  45 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  45.97 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  44.37 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2833  hypothetical protein  43.75 
 
 		 342 aa  263  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.226544  normal  0.225758 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  44.37 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  44.63 
 
 		 324 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  44.69 
 
 		 345 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5284  hypothetical protein  45.31 
 
 		 330 aa  262  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.145464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  44.69 
 
 		 345 aa  261  8e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0478  hypothetical protein  42.72 
 
 		 325 aa  261  8.999999999999999e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.606939  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43.46 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  42.35 
 
 		 335 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  44.33 
 
 		 330 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  45.15 
 
 		 318 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  42.48 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  44.63 
 
 		 335 aa  260  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  43.75 
 
 		 325 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  45.37 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  41.83 
 
 		 337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  42.53 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  44.12 
 
 		 314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.45 
 
 		 333 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.57 
 
 		 325 aa  258  8e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  45.13 
 
 		 358 aa  257  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>