More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0388 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 349 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0326  peptidase M48 Ste24p  60.17 
 
 		 353 aa  411  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.988889  normal  0.269331 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  40.79 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0258  peptidase M48, Ste24p  37.62 
 
 		 352 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00863149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1147  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 363 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1120  peptidase M48 Ste24p  33.62 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.597091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0096  peptidase M48, Ste24p  34.37 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.220235  normal  0.168407 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0644  putative transmembrane protein  32.01 
 
 		 358 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0581  peptidase M48 Ste24p  33.8 
 
 		 361 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.380263 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0537  peptidase M48 Ste24p  32.96 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.426689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0462  M48 family peptidase  33.33 
 
 		 357 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169095  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2801  peptidase M48, Ste24p  33.02 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.57827 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0514  peptidase M48 Ste24p  31.68 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0802067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  33.55 
 
 		 347 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2182  peptidase M48, Ste24p  34.54 
 
 		 349 aa  132  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0642  peptidase M48, Ste24p  32.05 
 
 		 347 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03032  peptidase  30.72 
 
 		 331 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0378  peptidase M48 Ste24p  29.81 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0429  peptidase M48 Ste24p  32.05 
 
 		 345 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2077  putative Zn-dependent protease  33.33 
 
 		 336 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1953  peptidase M48, Ste24p  29.69 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0119619  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0567  peptidase M48 Ste24p  29.93 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2917  peptidase M48, Ste24p  26.33 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.154407  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3721  peptidase M48, Ste24p  37.11 
 
 		 377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0533853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3004  peptidase M48 Ste24p  37.11 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.558677  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2660  peptidase M48 Ste24p  33.82 
 
 		 395 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.110854 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3686  peptidase M48 Ste24p  33.24 
 
 		 383 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3534  peptidase M48, Ste24p  32.75 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1893  peptidase M48, Ste24p  31.99 
 
 		 398 aa  109  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.118004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3622  peptidase M48 Ste24p  32.09 
 
 		 383 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3535  M48 family peptidase  28.95 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0872  M48 family peptidase  28.95 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3664  peptidase M48 Ste24p  28.95 
 
 		 348 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0790  peptidase M48, Ste24p  35.19 
 
 		 444 aa  97.1  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.534887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  39.33 
 
 		 479 aa  94  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2155  peptidase M48, Ste24p  32.01 
 
 		 327 aa  89.4  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  36.13 
 
 		 392 aa  86.3  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2756  peptidase M48, Ste24p  41.67 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.114844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3237  peptidase M48 Ste24p  38.19 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  37.58 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  32.95 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  38.93 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  37.75 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0456  peptidase M48 Ste24p  30.43 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  32.58 
 
 		 520 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  35.03 
 
 		 483 aa  79.7  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  35.62 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  35.62 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  35.71 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  34.44 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3399  peptidase M48 Ste24p  38.3 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  33.97 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  38.67 
 
 		 504 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  38.22 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  38.22 
 
 		 475 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  35.26 
 
 		 492 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1396  peptidase M48 Ste24p  31.03 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  33.97 
 
 		 524 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  35 
 
 		 478 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  36.42 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  36.71 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  34.23 
 
 		 278 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  38.93 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  33.75 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  38.93 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  37.02 
 
 		 262 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  38.78 
 
 		 497 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6656  putative metalloendopeptidase  33.81 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0813  peptidase M48 Ste24p  35.14 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  35.68 
 
 		 573 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  38.78 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  38.1 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  36.05 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  37.27 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  32.5 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  34.76 
 
 		 503 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  36.05 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  36.13 
 
 		 589 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  32.69 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3691  peptidase M48, Ste24p  38.13 
 
 		 359 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  34.05 
 
 		 605 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  36.13 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  36.13 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  34.88 
 
 		 589 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  36.13 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  32.02 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  36.13 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  34.88 
 
 		 589 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  36.13 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  34.76 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0200  peptidase M48, Ste24p  28.68 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0178367 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  36.05 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  29.06 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  36.73 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  36.55 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  38.51 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>