71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0967 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  100 
 
 
244 aa  497  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  35.34 
 
 
325 aa  132  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  29.05 
 
 
316 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  34.21 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  35.8 
 
 
282 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  36.99 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.13 
 
 
313 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  37.56 
 
 
322 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  34.63 
 
 
357 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  33.18 
 
 
363 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  37.26 
 
 
322 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  31.88 
 
 
317 aa  95.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  36.6 
 
 
344 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  32.88 
 
 
335 aa  92.8  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  35.35 
 
 
314 aa  92.8  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  34.4 
 
 
306 aa  92.4  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  28.98 
 
 
331 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  32.58 
 
 
280 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  36.3 
 
 
405 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.97 
 
 
353 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  33.33 
 
 
361 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  42.14 
 
 
322 aa  86.7  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  38.41 
 
 
305 aa  85.1  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  32.57 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  32.95 
 
 
392 aa  83.2  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  29.44 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.08 
 
 
326 aa  82.4  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  28.77 
 
 
341 aa  78.6  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  29.03 
 
 
309 aa  78.6  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.74 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  28.4 
 
 
795 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.75 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0364  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  44.71 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.81916  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  35.33 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  26.32 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  30.12 
 
 
471 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1240  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.17 
 
 
370 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.194401 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  24.26 
 
 
464 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.51 
 
 
287 aa  63.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.26 
 
 
451 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  30.71 
 
 
308 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  35.04 
 
 
563 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92192  predicted protein  30.83 
 
 
486 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.865019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  34.42 
 
 
269 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  32.06 
 
 
286 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.82 
 
 
462 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3198  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  29.81 
 
 
279 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.396095  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  26.7 
 
 
340 aa  54.3  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3488  hypothetical protein  25 
 
 
447 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26429  predicted protein  26.63 
 
 
363 aa  52.4  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000229905  normal  0.222049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  32.04 
 
 
461 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1536  putative polyhydroxybutyrate depolymerase  33.33 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26582  normal  0.221996 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  24.42 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3303  glycoside hydrolase family 62  30.48 
 
 
436 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000382833  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  32.71 
 
 
489 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0082  esterase, PHB depolymerase  31.37 
 
 
414 aa  46.2  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3289  PHB depolymerase family esterase  28.57 
 
 
683 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  24.2 
 
 
1002 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0658  PHB depolymerase family esterase  28.57 
 
 
683 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.726264 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  24.9 
 
 
419 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1052  phospholipase/carboxylesterase  37.88 
 
 
365 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3522  phospholipase/carboxylesterase  32 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.406594  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3857  PHB depolymerase family esterase  34.44 
 
 
414 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0137  esterase, PHB depolymerase  37.14 
 
 
392 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0568  esterase, PHB depolymerase family  42.86 
 
 
395 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0048  esterase, PHB depolymerase family  33.33 
 
 
417 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616843 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  34.31 
 
 
343 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  30.58 
 
 
306 aa  42.4  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0388  PHB depolymerase family esterase  37.8 
 
 
442 aa  42.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140919  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  30.21 
 
 
268 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  36.89 
 
 
423 aa  42  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>