More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02469 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  100 
 
 		 695 aa  1414    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  86.92 
 
 		 706 aa  1217    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  53.1 
 
 		 709 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  86.92 
 
 		 706 aa  1217    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  53.24 
 
 		 757 aa  715    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  45.58 
 
 		 707 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  47.1 
 
 		 715 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  46.86 
 
 		 694 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  46.1 
 
 		 792 aa  570  1e-161  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  43.58 
 
 		 770 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  43.58 
 
 		 710 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  44.25 
 
 		 710 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  44.62 
 
 		 719 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  32.99 
 
 		 727 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4395  TonB-dependent siderophore receptor  35.57 
 
 		 756 aa  323  9.000000000000001e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  34.29 
 
 		 700 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1961  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 		 705 aa  320  6e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.353089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4026  TonB-dependent siderophore receptor  36.11 
 
 		 755 aa  317  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.865466  normal  0.196913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2005  TonB-dependent siderophore receptor  35.01 
 
 		 724 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.22147  normal  0.931942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2282  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 		 724 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1260  TonB-dependent siderophore receptor  31.99 
 
 		 755 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2053  TonB-dependent siderophore receptor  35.17 
 
 		 719 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  35.64 
 
 		 712 aa  313  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3915  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 742 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3802  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 742 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.799699  normal  0.136718 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 689 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3077  TonB-dependent siderophore receptor  32.32 
 
 		 753 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  35.36 
 
 		 749 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  35.38 
 
 		 656 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  33.64 
 
 		 689 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3574  TonB-dependent siderophore receptor  29.65 
 
 		 734 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.647008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 		 698 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7101  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 732 aa  301  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 732 aa  297  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4480  TonB-dependent siderophore receptor  30.71 
 
 		 734 aa  297  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.938344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5005  TonB-dependent siderophore receptor  30.43 
 
 		 736 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5373  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 745 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.834495  normal  0.604125 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  33.13 
 
 		 680 aa  295  3e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2876  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 		 751 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2091  TonB-dependent siderophore receptor  31.46 
 
 		 735 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761777  normal  0.724468 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3280  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 		 707 aa  282  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0713327  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47140  putative TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 732 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 769 aa  279  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  31.37 
 
 		 864 aa  277  4e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3292  TonB-dependent siderophore receptor  31.14 
 
 		 771 aa  273  6e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4068  putative TonB-dependent receptor  32.44 
 
 		 733 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  28.92 
 
 		 850 aa  268  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  29.52 
 
 		 843 aa  267  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  29.05 
 
 		 860 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3917  TonB-dependent siderophore receptor  31.86 
 
 		 730 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121009 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 		 862 aa  262  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4786  TonB-dependent siderophore receptor  31.29 
 
 		 712 aa  262  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.789588  normal  0.608467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  32.51 
 
 		 741 aa  259  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3638  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 821 aa  259  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  32.12 
 
 		 817 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  30.93 
 
 		 696 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4617  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 		 741 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 701 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  30.93 
 
 		 696 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2996  TonB-dependent siderophore receptor  31.87 
 
 		 733 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18602  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 711 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3297  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 733 aa  254  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 		 825 aa  254  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  30.03 
 
 		 753 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2859  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 733 aa  252  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.335633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1055  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 720 aa  252  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.7 
 
 		 724 aa  252  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.17 
 
 		 703 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  29.97 
 
 		 825 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  31.36 
 
 		 722 aa  251  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  29.86 
 
 		 703 aa  250  7e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  30.28 
 
 		 731 aa  250  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 708 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 766 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 859 aa  248  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0238  TonB-dependent siderophore receptor  28.97 
 
 		 777 aa  248  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0584339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2944  TonB-dependent siderophore receptor  31.35 
 
 		 733 aa  248  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  31.4 
 
 		 743 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  29.77 
 
 		 747 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  30.24 
 
 		 734 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  30.57 
 
 		 714 aa  243  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 732 aa  243  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  29.88 
 
 		 736 aa  243  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2813  molybdate ABC transporter permease  29.93 
 
 		 743 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000103561  decreased coverage  0.000000463153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  27.89 
 
 		 709 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0723  TonB-dependent siderophore receptor  30 
 
 		 740 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0469238  normal  0.27958 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  31.47 
 
 		 718 aa  241  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 708 aa  240  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  29.19 
 
 		 709 aa  240  8e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02662  putative TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 693 aa  239  9e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.196813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  28.02 
 
 		 703 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 		 692 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 815 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  29.38 
 
 		 710 aa  238  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  31.32 
 
 		 715 aa  238  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 726 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2318  TonB-dependent siderophore receptor  28.73 
 
 		 724 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000356836  hitchhiker  0.000261806 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  30.72 
 
 		 712 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.92 
 
 		 711 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.34 
 
 		 833 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>