More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0869 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  100 
 
 		 352 aa  723    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  50.65 
 
 		 305 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  45.79 
 
 		 228 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  39.77 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  37.92 
 
 		 443 aa  188  9e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  35.97 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  39.35 
 
 		 652 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  37.84 
 
 		 744 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  34.91 
 
 		 787 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  35.68 
 
 		 743 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  36.84 
 
 		 725 aa  143  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  39.29 
 
 		 448 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  38.94 
 
 		 788 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  34.98 
 
 		 1193 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  31.92 
 
 		 1085 aa  132  9e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  35.32 
 
 		 619 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  34.36 
 
 		 697 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  35.94 
 
 		 656 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  34.73 
 
 		 434 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  37.02 
 
 		 671 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  37.04 
 
 		 656 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  36.16 
 
 		 432 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  33.87 
 
 		 478 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  35.1 
 
 		 680 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  34.92 
 
 		 665 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  33.06 
 
 		 478 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  35.08 
 
 		 639 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  35.9 
 
 		 698 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  35.26 
 
 		 653 aa  122  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  35.45 
 
 		 657 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  33.65 
 
 		 749 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  36.06 
 
 		 450 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  31.72 
 
 		 450 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  35.64 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  34.39 
 
 		 662 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  36.79 
 
 		 444 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  38.18 
 
 		 441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  36.04 
 
 		 578 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  37.82 
 
 		 622 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  42.07 
 
 		 682 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  34.1 
 
 		 689 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  34.12 
 
 		 634 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  31.75 
 
 		 570 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  41.78 
 
 		 687 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  31.75 
 
 		 570 aa  113  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  31.39 
 
 		 570 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  37.8 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  39.71 
 
 		 646 aa  110  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  35.23 
 
 		 569 aa  109  6e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  34.69 
 
 		 448 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  32.82 
 
 		 450 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  41.18 
 
 		 725 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  32.31 
 
 		 450 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  37 
 
 		 617 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  33.85 
 
 		 466 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  33.03 
 
 		 580 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  33.2 
 
 		 570 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  31.6 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  31.05 
 
 		 697 aa  104  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  32.37 
 
 		 459 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  32.29 
 
 		 577 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  34.1 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  32.53 
 
 		 477 aa  99.8  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0001  AAA ATPase central domain protein  31.1 
 
 		 866 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.41279 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  32.31 
 
 		 459 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  37.69 
 
 		 773 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  37.69 
 
 		 773 aa  94  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  36.03 
 
 		 771 aa  93.2  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  30.9 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  32.71 
 
 		 425 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  34.41 
 
 		 424 aa  90.9  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  31.2 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  32.84 
 
 		 372 aa  90.1  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  37.96 
 
 		 771 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  34.72 
 
 		 766 aa  89.4  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  29.2 
 
 		 371 aa  89.4  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29121  predicted protein  36.16 
 
 		 429 aa  89.4  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.429141  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  33.66 
 
 		 428 aa  88.6  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28219  predicted protein  38.85 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  30.04 
 
 		 391 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06718  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05752)  33.04 
 
 		 822 aa  87.8  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07091  hypothetical protein  37.41 
 
 		 753 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  37.76 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0564069 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  33.15 
 
 		 443 aa  87  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  31.25 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.82 
 
 		 732 aa  86.7  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  28.92 
 
 		 493 aa  86.7  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  32.26 
 
 		 335 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56164  TAT-binding homolog 7, AAA ATPase family  30.17 
 
 		 1051 aa  85.5  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  29.1 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  32.23 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  35 
 
 		 789 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  31.09 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  32.8 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  35.51 
 
 		 775 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  31.5 
 
 		 371 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  32.99 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31 
 
 		 718 aa  84.7  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  30.26 
 
 		 781 aa  84  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 		 756 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>