176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0342 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0342  pantothenate kinase  100 
 
 		 245 aa  503  9.999999999999999e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000123243  hitchhiker  0.00000000526749 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0314  pantothenate kinase  71.67 
 
 		 242 aa  374  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0345  pantothenate kinase  70.83 
 
 		 242 aa  370  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1780  pantothenate kinase  33.2 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0970015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03572  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.05 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000238909  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0407  pantothenate kinase  34.67 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000443662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0703  Baf family transcriptional activator  30.42 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00340053  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3511  pantothenate kinase  29.13 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2080  putative transcriptional acitvator, Baf  33.06 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3756  pantothenate kinase  31.65 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3653  pantothenate kinase  29.54 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0189  pantothenate kinase  29.34 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2168  pantothenate kinase  29.53 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3839  pantothenate kinase  28.52 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3614  pantothenate kinase  28.46 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4169  pantothenate kinase  28.69 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4044  pantothenate kinase  27.95 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0916  Baf family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00129811  hitchhiker  0.0000016025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0534  pantothenate kinase  28.19 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.571242  normal  0.0973939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0550  pantothenate kinase  28.19 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3925  pantothenate kinase  35.11 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.919266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0471  pantothenate kinase  38.31 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00197466  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08630  pantothenate kinase  36.3 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2081  pantothenate kinase  26.72 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0438  pantothenate kinase  37.89 
 
 		 249 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0443405  unclonable  0.00000023208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3391  pantothenate kinase  29.48 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.046141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4291  Baf family transcriptional activator  27.63 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0765187  hitchhiker  0.00000299945 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1675  putative transcriptional acitvator, Baf family  28.9 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0977  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.55 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.802454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1298  pantothenate kinase  26.09 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759253  normal  0.0557063 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1968  Baf family transcriptional activator  28.57 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06060  pantothenate kinase  28.26 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2402  pantothenate kinase  30.52 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4744  pantothenate kinase  27.56 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4563  pantothenate kinase  30.6 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101574  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3997  Baf family transcriptional activator  31.82 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000868707  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4765  pantothenate kinase  37.12 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00105612  normal  0.910992 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0074  pantothenate kinase  28.41 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4947  pantothenate kinase  27.38 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0817  pantothenate kinase  34.07 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0468  pantothenate kinase  37.12 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.584887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5095  pantothenate kinase  35.88 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1411  pantothenate kinase  29.05 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0611  transcriptional activator, putative, Baf family  36.57 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1947  putative transcriptional acitvator, Baf  31.66 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000199456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0441  pantothenate kinase  29.8 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0145979  normal  0.759124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0311  pantothenate kinase  27.86 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0461  putative transcriptional acitvator, Baf  28.28 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0166  pantothenate kinase  27.69 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0173  pantothenate kinase  26.82 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1808  pantothenate kinase  27.53 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.23683  normal  0.311218 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0874  pantothenate kinase  31.93 
 
 		 254 aa  62  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.349873  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1367  pantothenate kinase  27.89 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0234  pantothenate kinase  29.67 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1166  pantothenate kinase  25.67 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1772  pantothenate kinase  28.43 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04225  putative transcription regulator  28 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.649662  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1137  pantothenate kinase  29.55 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0103  pantothenate kinase  29.06 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2048  putative Baf family transcriptional acitvator  33.78 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.298954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0613  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.86 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0452  transcriptional activator, putative, Baf family  33.86 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0236  pantothenate kinase  27.56 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1357  pantothenate kinase  27.56 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1120  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.03 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0427  pantothenate kinase  27.56 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.322791  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0446  pantothenate kinase  27.56 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3205  pantothenate kinase  27.56 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0777  pantothenate kinase  28.57 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0238  putative transcriptional acitvator, Baf family  34.38 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1230  pantothenate kinase  33.14 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0447  pantothenate kinase  29.87 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0760069 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0070  pantothenate kinase  27.17 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0359  putative transcriptional acitvator, Baf family  33.11 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0044  pantothenate kinase  27.52 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.504635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3221  pantothenate kinase  27.38 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0044  pantothenate kinase  26.85 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2715  putative transcriptional activator, Baf family  29.38 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1376  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.56 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0638474  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1297  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.32 
 
 		 268 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.540193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0383  putative transcriptional acitvator, Baf family  26.88 
 
 		 257 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0273469  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0136  pantothenate kinase  28.28 
 
 		 274 aa  52.8  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291158 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0246  putative transcriptional acitvator, Baf family  29.14 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.269573  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5203  pantothenate kinase  27.98 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0369  pantothenate kinase  27.03 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0613208  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2229  pantothenate kinase  29.17 
 
 		 259 aa  52  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0217  pantothenate kinase  29.56 
 
 		 209 aa  52  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1791  Baf family transcriptional activator  29.8 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0064  pantothenate kinase  28 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0065  pantothenate kinase  28 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0061  pantothenate kinase  28 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0061  pantothenate kinase  28 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5243  pantothenate kinase  28 
 
 		 262 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.141011 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0065  pantothenate kinase  28 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3123  pantothenate kinase  31.78 
 
 		 258 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0077  pantothenate kinase  28 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.02884  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1150  pantothenate kinase  27.08 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0493406  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0073  pantothenate kinase  28.95 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.134654  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0405  pantothenate kinase  27.46 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747608  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0061  pantothenate kinase  28.67 
 
 		 262 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>