More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3403 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  49.27 
 
 		 781 aa  733    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  50.2 
 
 		 952 aa  780    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  52.32 
 
 		 869 aa  814    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  55.66 
 
 		 834 aa  892    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  50.93 
 
 		 936 aa  753    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  56.18 
 
 		 833 aa  912    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  48.16 
 
 		 948 aa  723    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  100 
 
 		 977 aa  1996    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  50.62 
 
 		 568 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  35.39 
 
 		 1055 aa  475  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  32.81 
 
 		 940 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  30.4 
 
 		 828 aa  346  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  29.78 
 
 		 827 aa  344  5.999999999999999e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  29.84 
 
 		 828 aa  340  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  30.11 
 
 		 837 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  29.99 
 
 		 837 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  30.37 
 
 		 828 aa  328  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  29.99 
 
 		 837 aa  326  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  0.0000028911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  30.92 
 
 		 833 aa  309  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  29.51 
 
 		 849 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 830 aa  283  9e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 779 aa  280  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.16 
 
 		 877 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.16 
 
 		 800 aa  275  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  30.16 
 
 		 875 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.8 
 
 		 877 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  30.08 
 
 		 823 aa  273  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  32.02 
 
 		 947 aa  268  4e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  33.55 
 
 		 753 aa  262  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  27.68 
 
 		 830 aa  250  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  28.88 
 
 		 846 aa  244  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  26.31 
 
 		 824 aa  238  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  28.34 
 
 		 812 aa  236  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 921 aa  231  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  28.2 
 
 		 919 aa  230  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  29.78 
 
 		 920 aa  229  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  28.67 
 
 		 931 aa  228  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  30.71 
 
 		 869 aa  226  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  27.65 
 
 		 910 aa  226  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  27.12 
 
 		 897 aa  226  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  27.49 
 
 		 915 aa  226  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  30.38 
 
 		 919 aa  226  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 869 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  27.02 
 
 		 912 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.47 
 
 		 920 aa  215  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  28.49 
 
 		 922 aa  213  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  26.19 
 
 		 852 aa  205  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  30.69 
 
 		 800 aa  196  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  29.18 
 
 		 791 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  28.73 
 
 		 803 aa  183  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  32.9 
 
 		 576 aa  181  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  33.72 
 
 		 425 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  26.84 
 
 		 580 aa  153  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000541966  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  28.24 
 
 		 605 aa  129  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000240824 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.08 
 
 		 478 aa  126  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  32.14 
 
 		 552 aa  114  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  32.14 
 
 		 552 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.34 
 
 		 552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  32.14 
 
 		 552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  27.27 
 
 		 579 aa  105  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  28.78 
 
 		 609 aa  95.5  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  29.29 
 
 		 606 aa  95.1  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  24.04 
 
 		 558 aa  94.7  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  23.85 
 
 		 558 aa  94.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  27.45 
 
 		 473 aa  94  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  23.85 
 
 		 558 aa  94.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000332683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  24.24 
 
 		 587 aa  94  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  26.28 
 
 		 603 aa  93.2  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  33.7 
 
 		 537 aa  90.9  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000856367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  29.63 
 
 		 565 aa  87.4  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5729  polysialic acid transport protein KpsD  25.3 
 
 		 606 aa  86.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1690  polysaccharide export protein  34.48 
 
 		 558 aa  84.7  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  34.9 
 
 		 516 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  30.39 
 
 		 557 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  32.66 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  30.18 
 
 		 373 aa  80.9  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  29.67 
 
 		 377 aa  79.7  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.45 
 
 		 703 aa  79.3  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 495 aa  78.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  29.55 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  27.95 
 
 		 379 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 379 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.95 
 
 		 379 aa  76.6  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  27.95 
 
 		 379 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.95 
 
 		 379 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.95 
 
 		 379 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.95 
 
 		 379 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 379 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  32.73 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.16 
 
 		 378 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  25.37 
 
 		 362 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  31.03 
 
 		 264 aa  73.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  22.01 
 
 		 992 aa  73.2  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  31.18 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  31.76 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  31.18 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  25.46 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  26.42 
 
 		 551 aa  72.4  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0359634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>