More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0061 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  51.89 
 
 		 841 aa  825    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  42.12 
 
 		 852 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  42.12 
 
 		 852 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  42.24 
 
 		 850 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  50.18 
 
 		 842 aa  828    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  42.12 
 
 		 852 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  100 
 
 		 899 aa  1847    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  53.41 
 
 		 843 aa  848    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  53.18 
 
 		 843 aa  847    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  41.63 
 
 		 848 aa  642    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  42.36 
 
 		 852 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  41.63 
 
 		 856 aa  633  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  41.39 
 
 		 848 aa  623  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  41.05 
 
 		 852 aa  619  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  41.28 
 
 		 852 aa  618  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  37.4 
 
 		 1043 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  39.87 
 
 		 2638 aa  603  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  50.47 
 
 		 640 aa  587  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  45.55 
 
 		 1136 aa  555  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  42.81 
 
 		 655 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  43.49 
 
 		 655 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  36.5 
 
 		 874 aa  492  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  39.73 
 
 		 647 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  41.73 
 
 		 825 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  37.58 
 
 		 1064 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  37.3 
 
 		 1064 aa  459  1e-127  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  38.79 
 
 		 713 aa  451  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  38.79 
 
 		 713 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  38.95 
 
 		 713 aa  452  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  38.95 
 
 		 713 aa  452  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  38.79 
 
 		 713 aa  452  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  37.87 
 
 		 713 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  38.59 
 
 		 713 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  37.87 
 
 		 713 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  39.18 
 
 		 718 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  37.75 
 
 		 713 aa  436  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  37.65 
 
 		 713 aa  439  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  36.87 
 
 		 712 aa  435  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  32.47 
 
 		 1888 aa  429  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  40.45 
 
 		 640 aa  381  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  32.32 
 
 		 928 aa  373  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  34 
 
 		 601 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  33.68 
 
 		 669 aa  329  2.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.69 
 
 		 1117 aa  322  3e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  34.56 
 
 		 766 aa  320  5e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.03 
 
 		 1176 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.77 
 
 		 1942 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  26.08 
 
 		 1429 aa  275  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.15 
 
 		 1855 aa  274  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  25.32 
 
 		 991 aa  271  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  26.24 
 
 		 1329 aa  263  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.84 
 
 		 2156 aa  259  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  28.45 
 
 		 1472 aa  259  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  28.19 
 
 		 1432 aa  254  4.0000000000000004e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  28.97 
 
 		 1450 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  28.83 
 
 		 1025 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  25.31 
 
 		 1328 aa  249  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  27.3 
 
 		 998 aa  249  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.82 
 
 		 1331 aa  248  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  25.8 
 
 		 1035 aa  247  8e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  28.28 
 
 		 1062 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  27.83 
 
 		 776 aa  244  7.999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  28.47 
 
 		 1441 aa  242  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.71 
 
 		 891 aa  238  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.11 
 
 		 1440 aa  232  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.11 
 
 		 1440 aa  232  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.79 
 
 		 946 aa  231  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  26.42 
 
 		 1252 aa  228  4e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.05 
 
 		 1891 aa  220  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.45 
 
 		 1124 aa  214  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.06 
 
 		 1975 aa  210  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.02 
 
 		 1248 aa  204  5e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  29.42 
 
 		 711 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.96 
 
 		 2068 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  29.42 
 
 		 711 aa  199  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0086  isoamylase  27.66 
 
 		 694 aa  197  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  28.72 
 
 		 693 aa  191  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  27.75 
 
 		 724 aa  191  7e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  27.11 
 
 		 714 aa  187  6e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  28.49 
 
 		 729 aa  185  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0328  glycogen debranching enzyme GlgX  27.15 
 
 		 710 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  27.83 
 
 		 721 aa  181  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1885  glycogen debranching enzyme GlgX  28.57 
 
 		 727 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  27.41 
 
 		 708 aa  180  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  28.07 
 
 		 666 aa  179  2e-43  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3295  glycogen debranching protein GlgX  28.82 
 
 		 695 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  28.96 
 
 		 706 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  27.58 
 
 		 706 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_19757  predicted protein  26.92 
 
 		 715 aa  177  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.13703  normal  0.0212411 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3070  glycogen debranching enzyme GlgX  26.73 
 
 		 686 aa  177  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0162429 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1350  glycogen debranching protein GlgX  28.43 
 
 		 776 aa  175  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6129  glycogen debranching enzyme GlgX  27.67 
 
 		 717 aa  174  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  27.91 
 
 		 694 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  27.91 
 
 		 694 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  27.31 
 
 		 721 aa  173  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1471  glycogen debranching enzyme GlgX  28.86 
 
 		 683 aa  173  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1247  glycoside hydrolase family 13 protein  30.06 
 
 		 703 aa  173  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4442  glycogen debranching enzyme GlgX  27.89 
 
 		 723 aa  172  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.405829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  28.71 
 
 		 700 aa  173  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  27.52 
 
 		 696 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>