More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1665 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1665  NusG antitermination factor  100 
 
 		 170 aa  342  2e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2594  transcription antitermination protein nusG  76.25 
 
 		 180 aa  258  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000665583  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0149  NusG antitermination factor  73.65 
 
 		 197 aa  256  1e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1589  NusG antitermination factor  75.78 
 
 		 184 aa  247  6e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262291  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0626  NusG antitermination factor  74.05 
 
 		 196 aa  240  7e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000497813  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0965  NusG antitermination factor  62.03 
 
 		 169 aa  205  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1511  NusG antitermination factor  62.13 
 
 		 172 aa  201  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3892  NGN domain protein  37.34 
 
 		 176 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5198  NusG antitermination factor  30.72 
 
 		 170 aa  95.1  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.296838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3605  NusG antitermination factor  30.67 
 
 		 174 aa  94.7  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  hitchhiker  0.000423635 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0546  NGN domain protein  32.3 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2360  NusG antitermination factor  34.59 
 
 		 185 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00889306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0357  NusG antitermination factor  32.19 
 
 		 154 aa  91.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6306  NusG antitermination factor  30.97 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.343168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0887  transcription antitermination protein nusG  30.13 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.769632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  30.3 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  32.28 
 
 		 212 aa  80.5  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5306  NusG antitermination factor  29.63 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955236  normal  0.0968328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3398  NusG antitermination factor  23.9 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191132  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2660  NusG antitermination factor  28.48 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192124  normal  0.041125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3498  transcription antitermination protein nusG  31.85 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2812  transcription antitermination protein nusG  24.5 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2844  NusG antitermination factor  29.05 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117724  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1374  transcription antitermination protein nusG  26.99 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000814975  hitchhiker  0.00000420235 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3036  transcriptional acivator RfaH  28.57 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00758207  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1469  transcriptional acivator RfaH  28.75 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000410204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2904  transcriptional acivator RfaH  28.75 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160957  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01331  transcriptional activator RfaH  28.05 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3466  NusG antitermination factor  26.71 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194  transcriptional activator rfaH, putative  27.95 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2894  transcriptional acivator RfaH  27.33 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000245267  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2544  NusG antitermination factor  26.71 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1314  transcription antitermination protein nusG  28.03 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0397005  normal  0.368263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1381  transcription antitermination protein nusG  28.03 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111282  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  30.11 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  30.68 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1398  NusG antitermination factor  27.88 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000128095  normal  0.158725 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  29.89 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2265  transcriptional activator rfaH, putative  26.06 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000106043  hitchhiker  0.00695369 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  29.05 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0191  NusG antitermination factor  29.37 
 
 		 191 aa  62  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382089  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0352  NusG antitermination factor  29.17 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000459133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3638  NusG antitermination factor  22.84 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0228  transcription antitermination protein nusG  29.86 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00207828  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  34 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0093  transcription antitermination protein nusG  25.32 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  29.29 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0826  transcriptional activator RfaH  24.05 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  30.32 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0511  transcriptional activator RfaH  25.64 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004133  transcriptional activator RfaH  25 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1650  transcriptional acivator RfaH  26.04 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0204524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1967  NusG antitermination factor  28.37 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.688216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2672  transcriptional activator RfaH  25.16 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000489964  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2265  NusG antitermination factor  24.69 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4222  transcriptional activator RfaH  23.38 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601937 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0314  NusG antitermination factor  27.78 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000044126  decreased coverage  0.000127563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  30 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0256  transcriptional activator RfaH  24.68 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03733  transcriptional activator RfaH  23.38 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4139  transcriptional acivator RfaH  23.38 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  31.91 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5280  transcriptional activator RfaH  23.38 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.311175  normal  0.111679 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03682  hypothetical protein  23.38 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  31.91 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4064  transcriptional activator RfaH  23.38 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  31.69 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  31.69 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  31.91 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1705  NusG antitermination factor  29.75 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0707648  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  31.69 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4360  transcriptional activator RfaH  23.38 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  31.91 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4168  transcriptional activator RfaH  23.38 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4311  transcriptional activator RfaH  23.38 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  31.69 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  31.91 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  31.91 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  31.91 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  31.91 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  28.17 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  31.69 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  27.46 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000819878  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3033  NusG antitermination factor  24.12 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201282  hitchhiker  0.00738104 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  30 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  31.69 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1394  transcriptional acivator RfaH  27.11 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133861  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  29.86 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  28.67 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3953  transcriptional activator RfaH  22.44 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.038453 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0311  NusG antitermination factor  31.21 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  26.71 
 
 		 243 aa  53.5  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  31.91 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1362  NusG antitermination factor  28.86 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0821693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  30.99 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0204  NusG antitermination factor  24.32 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  31.33 
 
 		 199 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0891  transcriptional activator  22.98 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  32.62 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  32.62 
 
 		 194 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>