264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1362 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1362  NusG antitermination factor  100 
 
 		 185 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0821693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0204  NusG antitermination factor  60.12 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0849  NusG antitermination factor  57.8 
 
 		 173 aa  207  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2445  NusG antitermination factor  33.14 
 
 		 172 aa  90.5  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.012878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1920  NusG antitermination factor  32.18 
 
 		 170 aa  89  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  hitchhiker  0.00427943 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12290  transcription antiterminator  31.21 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2239  NusG antitermination factor  33.15 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1881  NusG antitermination factor  30.99 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.541166  hitchhiker  0.00000716942 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1880  NusG antitermination factor  27.33 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  hitchhiker  0.00000812866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4226  NusG antitermination factor  26.16 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.841034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0844  transcription termination/antitermination factor NusG  26.51 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1702  NusG antitermination factor  27.93 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00942091  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00050  putative transcription antitermination protein  27.06 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1938  NusG antitermination factor  27.54 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0389  transcription antitermination protein NusG  27.44 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  24.57 
 
 		 184 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  25.15 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1967  NusG antitermination factor  26.11 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.688216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1636  NusG antitermination factor  36.59 
 
 		 85 aa  60.5  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0237  NusG antitermination factor  27.12 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3174  transcription antitermination protein nusG  23.53 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  23.43 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  25 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000819878  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0314  NusG antitermination factor  25 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000044126  decreased coverage  0.000127563 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  22.86 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  25 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0191  NusG antitermination factor  25.56 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  25.84 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2041  NusG antitermination factor  23.76 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  24.86 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0228  transcription antitermination protein nusG  25 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00207828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  25.14 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2182  NusG antitermination factor  24 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0729444  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  24.06 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0352  NusG antitermination factor  24.39 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000459133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  25.28 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1046  NusG antitermination factor  28.25 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0019  transcription antitermination protein NusG, putative  27.13 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000223141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  25 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  24.31 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  26.16 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1892  transcription antitermination protein nusG  22.1 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.194693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1665  NusG antitermination factor  28.86 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  25.42 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  22.91 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  21.67 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  22.41 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4482  NusG antitermination factor  22.94 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000412602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  24.29 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1401  hypothetical protein  25.9 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  24.86 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  25.43 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  20.25 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  23.95 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  24.58 
 
 		 176 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0520  NusG antitermination factor  25.95 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0396  transcription termination/antitermination factor NusG  25 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000310476  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0421  NusG antitermination factor  22.49 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000362021  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  24.58 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  23.46 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  26.19 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  23.16 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  24.86 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  22.41 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04536  transcription antitermination protein NusG  24.58 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  22.47 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0742  NusG antitermination factor  24.14 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  22.35 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  24.71 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  23.6 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  23.33 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  24.26 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  23.26 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  23.46 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  23.46 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  24.02 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  24.71 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  24.02 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  23.63 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  24.71 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  23.03 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  22.6 
 
 		 176 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  22.54 
 
 		 194 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  19.43 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  23.03 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  24.71 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1589  NusG antitermination factor  31.33 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  21.02 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  22.98 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  23.33 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  23.03 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2594  transcription antitermination protein nusG  28.24 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000665583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  21.59 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0149  NusG antitermination factor  30.34 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114969  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  26.06 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  24.86 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  23.89 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0164  transcription antitermination protein NusG  28.33 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  23.7 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  24.86 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>