More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1702 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1702  NusG antitermination factor  100 
 
 		 196 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00942091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0844  transcription termination/antitermination factor NusG  57.87 
 
 		 180 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1938  NusG antitermination factor  52.51 
 
 		 183 aa  187  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00050  putative transcription antitermination protein  50 
 
 		 183 aa  186  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3174  transcription antitermination protein nusG  49.46 
 
 		 185 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1401  hypothetical protein  48.92 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  50.28 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4482  NusG antitermination factor  48.9 
 
 		 186 aa  176  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000412602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0389  transcription antitermination protein NusG  48.59 
 
 		 179 aa  174  8e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  48.31 
 
 		 186 aa  171  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0421  NusG antitermination factor  45.3 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000362021  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1967  NusG antitermination factor  41.75 
 
 		 192 aa  151  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.688216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  42.13 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  37.88 
 
 		 194 aa  144  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  38.5 
 
 		 193 aa  144  9e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0314  NusG antitermination factor  43.52 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000044126  decreased coverage  0.000127563 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  39.8 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0228  transcription antitermination protein nusG  41.49 
 
 		 191 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00207828  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  38.46 
 
 		 194 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  41.34 
 
 		 174 aa  143  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  38 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0352  NusG antitermination factor  40.31 
 
 		 191 aa  142  3e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000459133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  42.78 
 
 		 176 aa  142  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0191  NusG antitermination factor  42.13 
 
 		 191 aa  142  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382089  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  40.68 
 
 		 175 aa  141  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  38.38 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  40.33 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  41.57 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  41.67 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  41.57 
 
 		 176 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  42.78 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  41.01 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 191 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000819878  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  38 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  38 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  38 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  38 
 
 		 185 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  39.27 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  41.81 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  38.78 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  38.78 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1492  NusG antitermination factor  39.78 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.509367  normal  0.372591 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  38.38 
 
 		 194 aa  136  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  38.27 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  38.27 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  38.27 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  38.27 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  40.45 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  40.56 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  40.11 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  37.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  37.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  41.57 
 
 		 177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  37.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  37.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  37.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  38.46 
 
 		 192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  37.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  37.76 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  38.89 
 
 		 176 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  40.45 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  38.89 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  40.11 
 
 		 176 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  40.11 
 
 		 177 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 176 aa  134  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  40.22 
 
 		 177 aa  134  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 177 aa  134  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 177 aa  134  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  37.56 
 
 		 202 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 176 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  42.05 
 
 		 178 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  38.76 
 
 		 176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  42.05 
 
 		 177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  41.09 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  42.05 
 
 		 177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  42.05 
 
 		 177 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  41.3 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  40 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0560  transcription antitermination protein nusG  43.02 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0227  transcription antitermination protein nusG  41.48 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  39.11 
 
 		 178 aa  132  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  38.33 
 
 		 176 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  37.43 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  37.43 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  37.43 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  40.88 
 
 		 188 aa  131  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  37.43 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  40.11 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  38.33 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  38.33 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  36.87 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  37.57 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0193  transcription antitermination protein NusG  40.54 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000930263  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0237  NusG antitermination factor  37.17 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  36.87 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  39.2 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>