201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12290 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12290  transcription antiterminator  100 
 
 		 169 aa  340  5.999999999999999e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2445  NusG antitermination factor  56.55 
 
 		 172 aa  201  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.012878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1880  NusG antitermination factor  47.02 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  hitchhiker  0.00000812866 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1920  NusG antitermination factor  45.29 
 
 		 170 aa  144  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  hitchhiker  0.00427943 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1881  NusG antitermination factor  35.93 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.541166  hitchhiker  0.00000716942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0204  NusG antitermination factor  34.68 
 
 		 188 aa  93.6  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1362  NusG antitermination factor  31.21 
 
 		 185 aa  87.4  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0821693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0849  NusG antitermination factor  32.57 
 
 		 173 aa  85.5  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4226  NusG antitermination factor  27.38 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.841034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2239  NusG antitermination factor  29.7 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000688878  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0957  transcription antitermination protein NusG  25.13 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0019  transcription antitermination protein NusG, putative  24.86 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.000223141  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0164  transcription antitermination protein NusG  25.97 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0742  NusG antitermination factor  25.14 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  24.05 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0560  transcription antitermination protein nusG  24 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  25 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  25 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  25 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  25 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  25 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0169  transcription antitermination protein NusG  26.7 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0213318  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0523  transcription antitermination protein NusG  25.6 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0829173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  21.51 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  23.39 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0503  transcription antitermination protein NusG  25.6 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000847234  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  23.33 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0176  transcription antitermination protein NusG  26.7 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  23.2 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  22.64 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  22.81 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  23.93 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  24.14 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1461  transcription antitermination protein NusG  26.79 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  23.33 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  23.33 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  24.14 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  24.57 
 
 		 190 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  22.1 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0227  transcription antitermination protein nusG  23.3 
 
 		 177 aa  51.6  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  23.6 
 
 		 183 aa  51.2  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  24.86 
 
 		 182 aa  51.2  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  21.64 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  24.86 
 
 		 178 aa  50.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  25.16 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000819878  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  22.01 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  24.86 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  24.72 
 
 		 238 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  22.99 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  25 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0136  NusG antitermination factor  25 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  23.16 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  23.12 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1967  NusG antitermination factor  23.12 
 
 		 192 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.688216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0348  transcription termination/antitermination factor NusG  25.44 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0068179  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  23.7 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  23.7 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  21.05 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  21.35 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  24.7 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1589  NusG antitermination factor  25.79 
 
 		 184 aa  48.5  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  22.29 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  22.42 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  23.46 
 
 		 181 aa  48.5  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0713  NusG family transcription antitermination protein  29.24 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0218939  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  23.12 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  22.09 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  24.44 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0191  NusG antitermination factor  23.93 
 
 		 191 aa  48.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  21.35 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000065431  hitchhiker  0.00000000191931 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  23.75 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  23.12 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  23.12 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  23.12 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  23.12 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  23.12 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  25.55 
 
 		 207 aa  47.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  23.12 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  24.16 
 
 		 182 aa  47.8  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  23.12 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  23.12 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  23.12 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  24.29 
 
 		 266 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2041  NusG antitermination factor  24.44 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1892  transcription antitermination protein nusG  22.22 
 
 		 176 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.194693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  23.03 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2182  NusG antitermination factor  22.22 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0729444  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0497  transcription termination/antitermination factor NusG  23.26 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  22.16 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  23.46 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0193  transcription antitermination protein NusG  23.7 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000930263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  23.46 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1423  transcription antitermination protein NusG  26.67 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  24.42 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  23.46 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  22.91 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  24.42 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  23.46 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  20.99 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  22.89 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>