83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0713 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0713  NusG family transcription antitermination protein  100 
 
 		 175 aa  354  2.9999999999999997e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0218939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4226  NusG antitermination factor  28.65 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.841034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1046  NusG antitermination factor  25.43 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2239  NusG antitermination factor  31.74 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1880  NusG antitermination factor  30 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  hitchhiker  0.00000812866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  23.81 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2445  NusG antitermination factor  28.32 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.012878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  24.71 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1920  NusG antitermination factor  26.74 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  hitchhiker  0.00427943 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  26.04 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  22.35 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  23.94 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  22.94 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  21.39 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1375  NusG antitermination factor  25.9 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  22.47 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  22.94 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0421  NusG antitermination factor  21.02 
 
 		 183 aa  48.1  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000362021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  20.23 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12290  transcription antiterminator  29.24 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  22.95 
 
 		 213 aa  47.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  25 
 
 		 212 aa  47.8  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  23.7 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  23.12 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  23.12 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  22.54 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  22.35 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  22.02 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1705  NusG antitermination factor  29.2 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0707648  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  22.86 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  24.29 
 
 		 177 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000127222  hitchhiker  0.00000238714 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1362  NusG antitermination factor  22.91 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0821693  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  23.67 
 
 		 179 aa  44.7  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  19.66 
 
 		 185 aa  44.7  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0444  transcription antitermination protein NusG  21.18 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00370515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  17.92 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  25.43 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  24.12 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  24.12 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1041  NusG antitermination factor  22.4 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0043552  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  21.95 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0204  NusG antitermination factor  24.57 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  21.91 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  27.42 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0176  transcription antitermination protein NusG  19.21 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1461  transcription antitermination protein NusG  21.76 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  22.16 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4482  NusG antitermination factor  20.33 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000412602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0635  transcription antitermination protein NusG  22.28 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  22.16 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  27.17 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0503  transcription antitermination protein NusG  21.76 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000847234  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  21.67 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  23.08 
 
 		 184 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  22.16 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  22.16 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00050  putative transcription antitermination protein  22.22 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0523  transcription antitermination protein NusG  21.76 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0829173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  20.23 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  23.84 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1589  NusG antitermination factor  23.39 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0965  NusG antitermination factor  30.65 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4014  transcription antitermination protein NusG  21.24 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  22.49 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  22.49 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1702  NusG antitermination factor  24.42 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00942091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  20.69 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  20.81 
 
 		 176 aa  42  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  21.64 
 
 		 178 aa  42  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  25.95 
 
 		 187 aa  42  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  20.67 
 
 		 177 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0849  NusG antitermination factor  23.43 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2551  transcription antitermination protein NusG  22.95 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000171979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  21.84 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  20.45 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  20.45 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0844  transcription termination/antitermination factor NusG  22.6 
 
 		 180 aa  41.2  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  22.47 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  21.35 
 
 		 177 aa  41.2  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2112  transcription antitermination protein NusG  20 
 
 		 185 aa  41.2  0.008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000834658  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0626  NusG antitermination factor  22.41 
 
 		 196 aa  41.2  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000497813  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  24.32 
 
 		 177 aa  40.8  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0237  NusG antitermination factor  20.25 
 
 		 192 aa  40.8  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>