More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1880 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1880  NusG antitermination factor  100 
 
 		 170 aa  342  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  hitchhiker  0.00000812866 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2445  NusG antitermination factor  49.11 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.012878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1920  NusG antitermination factor  47.34 
 
 		 170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.549773  hitchhiker  0.00427943 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12290  transcription antiterminator  47.02 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.369392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1881  NusG antitermination factor  38.55 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.541166  hitchhiker  0.00000716942 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0204  NusG antitermination factor  30.06 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1362  NusG antitermination factor  27.33 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0821693  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0849  NusG antitermination factor  29.14 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4226  NusG antitermination factor  27.54 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.841034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1375  NusG antitermination factor  28.07 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078055  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0523  transcription antitermination protein NusG  27.01 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0829173  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0503  transcription antitermination protein NusG  27.01 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000847234  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  24.73 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0176  transcription antitermination protein NusG  26.59 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0169  transcription antitermination protein NusG  27.59 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0213318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2239  NusG antitermination factor  28.57 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1461  transcription antitermination protein NusG  26.44 
 
 		 177 aa  60.8  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0713  NusG family transcription antitermination protein  30 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0218939  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  26.09 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0844  transcription termination/antitermination factor NusG  26.38 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  27.75 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  25.86 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  23.98 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  27.53 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  27.59 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  27.59 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  25.42 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  29.09 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  28.09 
 
 		 238 aa  57.8  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  27.07 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  27.22 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  28.41 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  28.3 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  25.88 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0444  transcription antitermination protein NusG  26.74 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00370515  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0311  NusG antitermination factor  26.16 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  25.15 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  25.15 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  28.3 
 
 		 177 aa  57.4  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  25.29 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1967  NusG antitermination factor  25.86 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.688216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  24.71 
 
 		 179 aa  57  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0421  NusG antitermination factor  26.71 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000362021  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  25.58 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  26.9 
 
 		 176 aa  57  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1938  NusG antitermination factor  28.57 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  27.59 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  28.57 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  23.98 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  23.98 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  25.56 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  23.98 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  22.22 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  26.44 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  27.33 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  28.48 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  26.83 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  26.44 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  27.01 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  27.78 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  27.27 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  28.74 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  24.02 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00050  putative transcription antitermination protein  26.71 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  29.31 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  28.57 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  23.98 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  27.67 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  24.56 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2336  transcription antitermination protein NusG  28.57 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000349971  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1321  transcription antitermination protein NusG  25.43 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  24.08 
 
 		 317 aa  54.7  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  26.74 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  23.98 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  23.98 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2041  NusG antitermination factor  24.57 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  22.22 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  22.22 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  24.12 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  21.95 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  28.48 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  21.64 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  23.84 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  23.98 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  25.86 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  22.41 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  25.86 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  27.91 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  25 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1867  transcription antitermination protein  24.56 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420515  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0322  transcription termination/antitermination factor NusG  24.56 
 
 		 173 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00302903  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  23.84 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  22.22 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2182  NusG antitermination factor  24 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0729444  normal  0.026966 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0348  transcription termination/antitermination factor NusG  24.28 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0068179  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  26.7 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  26.7 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  22.22 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  25.58 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  23.73 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>