More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00050 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00050  putative transcription antitermination protein  100 
 
 		 183 aa  363  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1938  NusG antitermination factor  74.32 
 
 		 183 aa  289  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0421  NusG antitermination factor  68.31 
 
 		 183 aa  269  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000362021  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0844  transcription termination/antitermination factor NusG  62.86 
 
 		 180 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3174  transcription antitermination protein nusG  57.61 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  58.76 
 
 		 184 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_002950  PG0389  transcription antitermination protein NusG  54.8 
 
 		 179 aa  197  7e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  52.84 
 
 		 186 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4482  NusG antitermination factor  53.3 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000412602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1702  NusG antitermination factor  50 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00942091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1401  hypothetical protein  47.54 
 
 		 186 aa  184  5e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  48.86 
 
 		 176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  48.86 
 
 		 176 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 		 185 aa  170  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  45.2 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  46.89 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  46.33 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  46.33 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  45.2 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  45.2 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  45.2 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  48.3 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  48.3 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  48.3 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  48.3 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  44.89 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  46.59 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0227  transcription antitermination protein nusG  48.86 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  45.45 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  46.59 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  44.07 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  44.32 
 
 		 176 aa  162  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  45.2 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 		 176 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  43.18 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  42.61 
 
 		 175 aa  158  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  42.61 
 
 		 175 aa  158  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  44.07 
 
 		 177 aa  158  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0742  NusG antitermination factor  45.81 
 
 		 179 aa  157  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  42.94 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  42.05 
 
 		 175 aa  156  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  46.02 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  43.18 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  42.05 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  41.71 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  40.45 
 
 		 185 aa  154  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  42.61 
 
 		 177 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  40.44 
 
 		 182 aa  153  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  40.44 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0560  transcription antitermination protein nusG  44.89 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  41.3 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  44 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  41.81 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  40.76 
 
 		 183 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  40.76 
 
 		 183 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  40.76 
 
 		 183 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  40.76 
 
 		 183 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  40.76 
 
 		 183 aa  150  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  40.76 
 
 		 183 aa  150  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  40.76 
 
 		 183 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  40.76 
 
 		 183 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  45.2 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  39.89 
 
 		 182 aa  150  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  40.22 
 
 		 183 aa  150  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  43.75 
 
 		 177 aa  150  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  40.76 
 
 		 183 aa  149  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  40.76 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  40.11 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  42.94 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  42.37 
 
 		 194 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  42.37 
 
 		 194 aa  148  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  41.48 
 
 		 199 aa  148  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0136  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  40.91 
 
 		 176 aa  148  5e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0311  NusG antitermination factor  40.91 
 
 		 177 aa  148  5e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  42.7 
 
 		 179 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  42.7 
 
 		 179 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  42.7 
 
 		 179 aa  147  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000065431  hitchhiker  0.00000000191931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  39.01 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  37.85 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  41.48 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  43.18 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  40.56 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  42.13 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  37.64 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  43.26 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>