More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0421 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0421  NusG antitermination factor  100 
 
 		 183 aa  366  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000362021  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00050  putative transcription antitermination protein  68.31 
 
 		 183 aa  269  2e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1938  NusG antitermination factor  67.8 
 
 		 183 aa  256  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0844  transcription termination/antitermination factor NusG  57.14 
 
 		 180 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3174  transcription antitermination protein nusG  52.75 
 
 		 185 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  49.73 
 
 		 184 aa  190  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_002950  PG0389  transcription antitermination protein NusG  51.41 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  49.43 
 
 		 186 aa  182  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1401  hypothetical protein  46.15 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4482  NusG antitermination factor  45.99 
 
 		 186 aa  174  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000412602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1702  NusG antitermination factor  45.3 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00942091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  45.81 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  45.81 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  43.82 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  45.81 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  44.44 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  42.46 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  42.46 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  42.46 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  45.51 
 
 		 176 aa  157  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  45.51 
 
 		 176 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  42.61 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  44.13 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  42.61 
 
 		 176 aa  154  9e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0227  transcription antitermination protein nusG  45.45 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  43.58 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  44.13 
 
 		 176 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  43.75 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  43.18 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  42.29 
 
 		 177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  42.61 
 
 		 177 aa  150  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  40.91 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  40.91 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  43.18 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  42.37 
 
 		 176 aa  148  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  41.81 
 
 		 176 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  43.75 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  41.71 
 
 		 177 aa  148  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  42.13 
 
 		 177 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  42.13 
 
 		 177 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  42.13 
 
 		 177 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  42.13 
 
 		 178 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 176 aa  147  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  40.34 
 
 		 175 aa  147  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 176 aa  147  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  41.71 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  41.01 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  38.42 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  39.66 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  37.7 
 
 		 195 aa  145  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  42.29 
 
 		 177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0560  transcription antitermination protein nusG  43.18 
 
 		 177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  42.29 
 
 		 177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  41.01 
 
 		 177 aa  144  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0742  NusG antitermination factor  41.34 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  41.14 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  40.78 
 
 		 177 aa  141  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  40.57 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0311  NusG antitermination factor  38.86 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  39.55 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  39.56 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  40.11 
 
 		 181 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2336  transcription antitermination protein NusG  42.05 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000349971  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  38.86 
 
 		 178 aa  138  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  37.29 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  39.77 
 
 		 180 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  38.67 
 
 		 191 aa  138  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000819878  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  39.33 
 
 		 177 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  38.25 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  36.55 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  38.76 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  39.2 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  44.32 
 
 		 180 aa  136  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  39.33 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  38.98 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  39.77 
 
 		 183 aa  135  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  38.92 
 
 		 273 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>