More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0389 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0389  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
179 aa  359  1e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00050  putative transcription antitermination protein  54.8 
 
 
183 aa  197  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1938  NusG antitermination factor  54.75 
 
 
183 aa  197  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0844  transcription termination/antitermination factor NusG  53.63 
 
 
180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0421  NusG antitermination factor  51.41 
 
 
183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000362021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  52 
 
 
186 aa  180  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  50.56 
 
 
184 aa  176  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3174  transcription antitermination protein nusG  53.3 
 
 
185 aa  174  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1702  NusG antitermination factor  48.59 
 
 
196 aa  174  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00942091  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1401  hypothetical protein  44.51 
 
 
186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4482  NusG antitermination factor  46.41 
 
 
186 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000412602  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  46.82 
 
 
176 aa  150  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  44.77 
 
 
175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  44.77 
 
 
175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  44.77 
 
 
175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  44.83 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  45.66 
 
 
176 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  44.57 
 
 
177 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  44.57 
 
 
177 aa  144  6e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  45.4 
 
 
176 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  44.25 
 
 
176 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  44 
 
 
177 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  44 
 
 
177 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  43.93 
 
 
176 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  44 
 
 
177 aa  143  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  43.93 
 
 
176 aa  142  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  42.46 
 
 
183 aa  142  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  42.78 
 
 
180 aa  141  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  42.86 
 
 
177 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  43.68 
 
 
177 aa  140  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  43.02 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  45 
 
 
199 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  41.81 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  41.95 
 
 
176 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  43.65 
 
 
181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  43.65 
 
 
181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  43.35 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  43.65 
 
 
181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  41.62 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  42.77 
 
 
177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  43.93 
 
 
176 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  41.34 
 
 
183 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  43.65 
 
 
181 aa  138  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  43.65 
 
 
182 aa  137  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  137  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  43.93 
 
 
176 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  137  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  40.78 
 
 
183 aa  137  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000065431  hitchhiker  0.00000000191931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  43.93 
 
 
176 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  43.35 
 
 
176 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  43.35 
 
 
176 aa  136  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0136  NusG antitermination factor  40.56 
 
 
183 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  42.54 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  41.01 
 
 
185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  42.54 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  40.34 
 
 
175 aa  135  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  42.77 
 
 
176 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  42.29 
 
 
177 aa  135  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  42.37 
 
 
183 aa  134  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  42.37 
 
 
183 aa  134  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  42.37 
 
 
183 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  42.37 
 
 
183 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  42.37 
 
 
183 aa  135  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  41.14 
 
 
175 aa  134  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
182 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  42.37 
 
 
183 aa  134  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 
182 aa  134  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  42.2 
 
 
176 aa  134  9e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  42.37 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  42.37 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0192  transcription antitermination protein NusG  41.99 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000156554  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  42.77 
 
 
176 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  40.98 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1492  NusG antitermination factor  39.88 
 
 
178 aa  133  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.509367  normal  0.372591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  42.37 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  42.37 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  39.23 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  41.71 
 
 
181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  42.29 
 
 
176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  42.29 
 
 
177 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  40.11 
 
 
194 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  40.46 
 
 
175 aa  131  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  40.11 
 
 
194 aa  131  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  40.46 
 
 
175 aa  131  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  40.22 
 
 
177 aa  131  6e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  43.18 
 
 
177 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>