More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0844 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0844  transcription termination/antitermination factor NusG  100 
 
 		 180 aa  360  6e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.508276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1938  NusG antitermination factor  64 
 
 		 183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00050  putative transcription antitermination protein  62.86 
 
 		 183 aa  233  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3174  transcription antitermination protein nusG  62.3 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  58.24 
 
 		 184 aa  217  7.999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  56.98 
 
 		 186 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0421  NusG antitermination factor  57.14 
 
 		 183 aa  212  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000000362021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1702  NusG antitermination factor  57.87 
 
 		 196 aa  207  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00942091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4482  NusG antitermination factor  55.49 
 
 		 186 aa  201  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000412602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0389  transcription antitermination protein NusG  53.63 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1401  hypothetical protein  51.09 
 
 		 186 aa  191  5e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  45.98 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  44.57 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  45.71 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  45.4 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  44.83 
 
 		 176 aa  160  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  45.4 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  45.4 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  45.4 
 
 		 178 aa  160  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  45.4 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0352  NusG antitermination factor  45.09 
 
 		 191 aa  160  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000459133  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  43.68 
 
 		 177 aa  160  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  45.4 
 
 		 177 aa  160  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  44.25 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  44.25 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  44.25 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  45.45 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  45.35 
 
 		 191 aa  159  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000819878  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  44.83 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0311  NusG antitermination factor  44 
 
 		 177 aa  159  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  44.89 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  44.83 
 
 		 176 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  44.25 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  44.89 
 
 		 176 aa  157  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  45.4 
 
 		 176 aa  158  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 		 176 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0191  NusG antitermination factor  44.51 
 
 		 191 aa  157  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  45.4 
 
 		 176 aa  157  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  44.63 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  44.25 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  44.25 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  44.25 
 
 		 185 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1967  NusG antitermination factor  44.83 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.688216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  44.89 
 
 		 176 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  43.43 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  43.1 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  42.94 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  43.1 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  46.55 
 
 		 177 aa  154  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0227  transcription antitermination protein nusG  44.57 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  42.86 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  44.25 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  42.2 
 
 		 191 aa  154  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  44.57 
 
 		 203 aa  154  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  44 
 
 		 192 aa  154  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  43.18 
 
 		 179 aa  154  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  43.18 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  43.48 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  44.25 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  43.18 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  43.68 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0228  transcription antitermination protein nusG  41.62 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00207828  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  44.25 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  43.43 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  43.18 
 
 		 179 aa  151  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  43.68 
 
 		 176 aa  151  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  41.71 
 
 		 178 aa  151  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  44.83 
 
 		 177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  42.53 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  41.71 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  44.25 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  43.68 
 
 		 177 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  41.14 
 
 		 199 aa  148  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0314  NusG antitermination factor  43.6 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000044126  decreased coverage  0.000127563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  40 
 
 		 196 aa  147  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0742  NusG antitermination factor  43.43 
 
 		 179 aa  147  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  40 
 
 		 196 aa  147  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2041  NusG antitermination factor  40 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0560  transcription antitermination protein nusG  42.29 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  40 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  40.8 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  43.1 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  41.71 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  39.89 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  40.8 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  41.81 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  42.53 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  42.53 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  40 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  41.95 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  42.37 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  41.95 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  41.95 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  41.95 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  41.95 
 
 		 185 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>