More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0812 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 659 aa  1338    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  35.2 
 
 		 646 aa  335  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  33.69 
 
 		 642 aa  327  5e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  34.63 
 
 		 634 aa  323  6e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 673 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  31.93 
 
 		 671 aa  279  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3807  TonB-dependent receptor plug  31.74 
 
 		 655 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 692 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  31.88 
 
 		 695 aa  273  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6080  putative TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 690 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5676  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 662 aa  264  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1957  TonB-dependent receptor, putative  29.97 
 
 		 638 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0488183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1339  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 714 aa  253  5.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.368228 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6077  TonB-dependent receptor plug  30.45 
 
 		 656 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.762724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6079  putative TonB-dependent receptor  30 
 
 		 680 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0972806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 634 aa  239  9e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  31.48 
 
 		 613 aa  238  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3189  TonB-dependent receptor, plug  29.54 
 
 		 623 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3097  TonB-dependent receptor, plug  30.17 
 
 		 671 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2092  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 670 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2514  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 632 aa  186  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 682 aa  181  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.95 
 
 		 631 aa  179  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 618 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 627 aa  173  9e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1110  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 625 aa  170  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000459108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.75 
 
 		 623 aa  168  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3783  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.96 
 
 		 615 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000781057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3696  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 620 aa  163  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.6 
 
 		 631 aa  162  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2789  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 698 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.973502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2735  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 641 aa  161  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00964506  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0628  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  23.83 
 
 		 638 aa  158  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288278  normal  0.81106 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0654  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 638 aa  158  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.561107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2063  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 645 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.785465  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 737 aa  157  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  29.03 
 
 		 628 aa  157  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 614 aa  157  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.48 
 
 		 631 aa  157  7e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03647  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 640 aa  153  8e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00288042  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 615 aa  153  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  27.42 
 
 		 617 aa  151  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1537  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 593 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00891985  normal  0.735799 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 635 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2342  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 611 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.499314  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1186  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 634 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.874956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4413  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.92 
 
 		 614 aa  147  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000903793  hitchhiker  0.00898611 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 626 aa  147  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 626 aa  146  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  27.77 
 
 		 1023 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2402  putative TonB dependent vitamin B12 outer membrane receptor  26.15 
 
 		 611 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1266  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 679 aa  144  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152296  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1065  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 611 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.362217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  26.17 
 
 		 628 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2667  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 627 aa  142  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0986558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2209  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 624 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.400233 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 613 aa  140  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 647 aa  140  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002156  outer membrane vitamin B12 receptor BtuB  25.91 
 
 		 611 aa  140  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000122091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 602 aa  140  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 702 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.74 
 
 		 619 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.13 
 
 		 696 aa  139  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1684  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 668 aa  138  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  26.38 
 
 		 696 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 616 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3730  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 637 aa  137  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0159073  normal  0.0113192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 614 aa  137  7.000000000000001e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 740 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 632 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 653 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.41 
 
 		 618 aa  134  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0969  outer membrane receptor for transport of vitamin B  25.64 
 
 		 645 aa  134  6.999999999999999e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.01117 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1926  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 627 aa  133  7.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.201933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 635 aa  133  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4119  TonB-dependent vitamin B12 receptor  26.89 
 
 		 616 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  26.58 
 
 		 663 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  26.58 
 
 		 663 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  25.97 
 
 		 640 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  26.43 
 
 		 663 aa  132  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  26.43 
 
 		 663 aa  132  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  26.39 
 
 		 656 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  26.43 
 
 		 641 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  26.43 
 
 		 663 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  26.43 
 
 		 663 aa  132  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1651  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 648 aa  131  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613844 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  26.59 
 
 		 659 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 619 aa  130  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 597 aa  130  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5008  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 627 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.877838 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 714 aa  128  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  24.85 
 
 		 614 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 698 aa  127  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 613 aa  126  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2400  outer membrane receptor protein  26.38 
 
 		 621 aa  125  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.901841 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0461  TonB-dependent vitamin B12 receptor  25.19 
 
 		 613 aa  124  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00224002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  25.21 
 
 		 695 aa  123  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 698 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 698 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  26.42 
 
 		 661 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>