127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1100 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1100  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  275  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00019411  unclonable  0.00000000000227282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3198  type II general secretion pathway (GSP) G protein  70.68 
 
 		 138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0615  hypothetical protein  48.51 
 
 		 144 aa  133  7.000000000000001e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108587  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  30.48 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  29.7 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  29.7 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  26.67 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  33.33 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  33.33 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  34.85 
 
 		 176 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  24.07 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  40.35 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  27.94 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3940  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 154 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.18178 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.36 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  26.27 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4497  general secretion pathway protein G  32.1 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0263  pilin polypeptide  34.43 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  35.48 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.95 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.1 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20881  pilin  31.37 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  21.95 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3074  general secretion pathway protein G  29.27 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016497 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  24.04 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  28.93 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  28.17 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0788  fimbrial protein pilin  24.39 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3240  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0048  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.503149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  27.83 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5689  general secretion pathway protein G  32.84 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.128164  normal  0.128064 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0059  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3419  general secretion pathway protein G  37.7 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000422428 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0058  general secretion pathway protein G  30.77 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.663302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.56 
 
 		 193 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  29.55 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1351  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.346821  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0675  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.186648  normal  0.343045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  24.51 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  29.58 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  27.88 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0654  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0121173  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  23.36 
 
 		 161 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0012  general secretion pathway protein G  29.49 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0058  general secretion pathway protein G  29.49 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.109015  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0505  fimbrial protein pilin  25 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0077  general secretion pathway protein G  29.49 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0534  general secretion pathway protein G  34.33 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  23.28 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  31.88 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1081  general secretion pathway protein G  34.43 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464773  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.71 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.82 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  32.41 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3221  general secretion pathway protein G  34.43 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3128  general secretion pathway protein G  34.43 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729977 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  27.36 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3391  general secretion pathway protein G  32.89 
 
 		 156 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  32.18 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3384  general secretion pathway protein G  31.75 
 
 		 154 aa  43.9  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3044  general secretion pathway protein G  32.89 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.21279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  31.82 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0100  general secretion pathway protein G  36.78 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1280  general secretion pathway protein G  29.51 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4829  HxcT pseudopilin  27.78 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2109  general secretion pathway protein G  33.33 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1609  general secretion pathway protein G  23.19 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.784305  normal  0.423382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5269  general secretory pathway protein  34.33 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.77 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.33 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.85 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3106  putative general secretion pathway G transmembrane protein  36.67 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.590033  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2781  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0224  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0048  pilin polypeptide PilA-like  44.44 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.335089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0011  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3577  ATPase  33.33 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.44565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55490  HxcT pseudopilin  27.78 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.04599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0925  general secretion pathway protein G  35 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0172546  normal  0.856291 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3514  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.957184  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3824  fimbrial protein pilin  28.77 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0456668 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20891  pilin  29.11 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1886  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.354233  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0012  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0012  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127302  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2666  general secretion pathway protein G  30 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16150  General secretion pathway protein G  36.36 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1473  general secretion pathway protein G  32.47 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.660645  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  36.67 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  30.3 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0049  pilin polypeptide PilA-like  44.44 
 
 		 144 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0965276  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4074  protein of unknown function DUF1559  39.29 
 
 		 321 aa  42  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  27.94 
 
 		 130 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  27.94 
 
 		 130 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  27.94 
 
 		 130 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  23.88 
 
 		 155 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.82 
 
 		 163 aa  42  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0231  general secretion pathway protein G  28.79 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>