85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3725 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  100 
 
 		 455 aa  934    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  59.78 
 
 		 452 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  54.96 
 
 		 482 aa  533  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3137  ATPas  59.25 
 
 		 449 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.828607 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  36.72 
 
 		 423 aa  268  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  36.34 
 
 		 422 aa  262  8.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  32.87 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3357  SMC domain-containing protein  31.29 
 
 		 437 aa  194  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2697  AAA ATPase  29.87 
 
 		 410 aa  156  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.308966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3030  SMC domain-containing protein  28.86 
 
 		 406 aa  154  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.726851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0257  ATPase  30.96 
 
 		 403 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.116042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5113  hypothetical protein  28.41 
 
 		 422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3668  hypothetical protein  26.76 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12244  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1964  hypothetical protein  54.37 
 
 		 203 aa  134  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0419  hypothetical protein  26.2 
 
 		 421 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.247719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0626  SMC domain protein  27.75 
 
 		 439 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  23.21 
 
 		 440 aa  120  7e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0004  ATP binding protein  26.19 
 
 		 454 aa  116  6e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1600  ATPase  26.68 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0426773  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2940  hypothetical protein  26.88 
 
 		 410 aa  108  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2683  hypothetical protein  27.64 
 
 		 478 aa  106  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.497582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0742  antigen PgaA  24.57 
 
 		 445 aa  106  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0201  hypothetical protein  25.57 
 
 		 442 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0853474 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6340  SMC domain protein  32.99 
 
 		 420 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4982  hypothetical protein  44.57 
 
 		 464 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.577043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2903  ATP-binding protein involved in virulence-like protein  31.68 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0928  SMC domain protein  31.17 
 
 		 577 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.384804  normal  0.0676455 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4173  AAA ATPase  31.85 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5461  AAA ATPase  31.93 
 
 		 769 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.323053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0023  AAA ATPase  33.59 
 
 		 736 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1963  hypothetical protein  27.23 
 
 		 265 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5503  AAA ATPase  25.28 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0328038  hitchhiker  0.00036536 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7060  hypothetical protein  33.93 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0743  hypothetical protein, putative phage gene  33.02 
 
 		 414 aa  70.5  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3443  SMC domain-containing protein  40.43 
 
 		 709 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0416993  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0397  ATPase  34.21 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0641  AAA ATPase  24.29 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.157065 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2599  hypothetical protein  39.78 
 
 		 619 aa  63.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00474195  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1791  hypothetical protein  35.11 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2531  hypothetical protein  24.73 
 
 		 608 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.41472  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3230  hypothetical protein  43.28 
 
 		 113 aa  60.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0080421  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0493  hypothetical protein  26.04 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.068743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0111  hypothetical protein  31.78 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0472  AAA ATPase  32.65 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  24.16 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0120  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.93 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0681  ATP-dependent endonuclease of the OLD family  35.9 
 
 		 353 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.734229 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1424  hypothetical protein  47.27 
 
 		 712 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  34.62 
 
 		 352 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1606  ATPase  25.89 
 
 		 368 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00139192 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4238  ABC transporter  30.28 
 
 		 588 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0885  hypothetical protein  29.9 
 
 		 670 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0242137  hitchhiker  0.00462841 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2487  hypothetical protein  19.94 
 
 		 336 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0753624  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  41.79 
 
 		 708 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2504  hypothetical protein  26.45 
 
 		 176 aa  50.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2727  ABC transporter  29.32 
 
 		 601 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0007  AAA ATPase  24.86 
 
 		 380 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5274  hypothetical protein  22.33 
 
 		 519 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  24.87 
 
 		 976 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3008  hypothetical protein  30.69 
 
 		 582 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.568683  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  33.33 
 
 		 654 aa  48.5  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1018  hypothetical protein  29.66 
 
 		 606 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88989e-33 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3206  ATPase  29.82 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1398  hypothetical protein  51.22 
 
 		 610 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0859  putative excinuclease ATPase subunit  24.78 
 
 		 450 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3922  hypothetical protein  20.23 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658608 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4526  hypothetical protein  43.14 
 
 		 452 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0455  hypothetical protein  31.03 
 
 		 452 aa  47.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3577  hypothetical protein  28.95 
 
 		 458 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.292222 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0103  ATPase  30.53 
 
 		 423 aa  47  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4877  AAA ATPase  23.5 
 
 		 591 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0546065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4129  hypothetical protein  38.46 
 
 		 708 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0203002 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1781  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.690073  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4055  hypothetical protein  46.67 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.945685  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3598  AAA ATPase  31.82 
 
 		 530 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.234034  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2572  SMC domain-containing protein  40 
 
 		 263 aa  45.8  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0665735  normal  0.170232 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2959  hypothetical protein  27.1 
 
 		 533 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0733  hypothetical protein  25.62 
 
 		 461 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.987867  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  29.13 
 
 		 666 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4015  ABC transporter, ATP-binding protein-related protein  29.79 
 
 		 556 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2157  AAA ATPase  33.33 
 
 		 250 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000180091  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5923  hypothetical protein  29.51 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2313  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  44.44 
 
 		 496 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3405  ATP-binding protein  29.91 
 
 		 454 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00177365  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0674  hypothetical protein  45.45 
 
 		 591 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787225  normal  0.308405 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>