More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0931 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4917  TonB-dependent siderophore receptor  52.6 
 
 		 778 aa  698    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.705684  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  68.12 
 
 		 796 aa  1101    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1422  TonB-dependent siderophore receptor  55.94 
 
 		 881 aa  893    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5895  TonB-dependent siderophore receptor  52.57 
 
 		 827 aa  838    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1180  TonB-dependent siderophore receptor  59.76 
 
 		 679 aa  863    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.14569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  49.48 
 
 		 707 aa  672    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  67.87 
 
 		 796 aa  1090    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  59.77 
 
 		 810 aa  966    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0020  TonB-dependent siderophore receptor  55.94 
 
 		 881 aa  893    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 809 aa  1657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  48.81 
 
 		 721 aa  657    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1162  TonB-dependent siderophore receptor  55.81 
 
 		 881 aa  888    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283901  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4504  TonB-dependent siderophore receptor  52.3 
 
 		 858 aa  863    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.198405  normal  0.487097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  68.49 
 
 		 796 aa  1113    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0418  TonB-dependent siderophore receptor  55.81 
 
 		 921 aa  889    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  68.24 
 
 		 796 aa  1101    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1381  TonB-dependent siderophore receptor  60.66 
 
 		 742 aa  878    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00176773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4239  TonB-dependent siderophore receptor  54.15 
 
 		 781 aa  727    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.475083 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0139  TonB-dependent siderophore receptor  55.81 
 
 		 921 aa  889    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354912  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3999  putative TonB-dependent siderophore receptor  52.28 
 
 		 821 aa  803    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0797719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0879  TonB-dependent siderophore receptor  52.37 
 
 		 855 aa  849    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.136442  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  48.79 
 
 		 708 aa  654    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  50.45 
 
 		 719 aa  662    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  53.59 
 
 		 766 aa  748    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1933  TonB-dependent siderophore receptor  53.2 
 
 		 863 aa  866    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57776  hitchhiker  0.00557515 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  63.76 
 
 		 795 aa  1006    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  63.64 
 
 		 795 aa  987    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1361  TonB-dependent siderophore receptor  52.37 
 
 		 855 aa  849    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.586931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1509  TonB-dependent siderophore receptor  54.85 
 
 		 882 aa  884    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.826442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  46.44 
 
 		 714 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  46.29 
 
 		 714 aa  631  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  46.44 
 
 		 677 aa  632  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  45.52 
 
 		 724 aa  622  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  45.55 
 
 		 713 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  45.55 
 
 		 713 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3442  TonB-dependent siderophore receptor  44.63 
 
 		 713 aa  579  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.827795  normal  0.101631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3574  TonB-dependent siderophore receptor, putative  43.84 
 
 		 706 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0006  TonB-dependent siderophore receptor  43.67 
 
 		 709 aa  551  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3345  TonB-dependent siderophore receptor  42.96 
 
 		 705 aa  545  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0305411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  42.39 
 
 		 726 aa  532  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0414  TonB-dependent siderophore receptor  39.18 
 
 		 731 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0673732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3121  TonB-dependent siderophore receptor  39.56 
 
 		 722 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5026  TonB-dependent siderophore receptor  39.71 
 
 		 722 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5246  TonB-dependent siderophore receptor  39.56 
 
 		 722 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4597  TonB-dependent siderophore receptor  38.21 
 
 		 725 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.832775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5130  TonB-dependent siderophore receptor  38.8 
 
 		 725 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.944622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  35.8 
 
 		 793 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  42.36 
 
 		 582 aa  426  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 		 706 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 722 aa  308  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  33.62 
 
 		 701 aa  306  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  32.03 
 
 		 708 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 		 757 aa  295  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 		 710 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 712 aa  282  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  31.02 
 
 		 708 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  30.93 
 
 		 703 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.87 
 
 		 696 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  32.28 
 
 		 711 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  31.77 
 
 		 696 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.51 
 
 		 711 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 		 709 aa  272  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 722 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  30.84 
 
 		 703 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  31.31 
 
 		 710 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.15 
 
 		 703 aa  266  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  31.04 
 
 		 692 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  31.63 
 
 		 689 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.88 
 
 		 815 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  32.47 
 
 		 708 aa  258  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  31 
 
 		 714 aa  257  6e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  29.55 
 
 		 792 aa  256  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  31.75 
 
 		 709 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  31.46 
 
 		 734 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  31.62 
 
 		 703 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 860 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 710 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  31.85 
 
 		 825 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 794 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 732 aa  250  1e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 799 aa  249  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 820 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  31.53 
 
 		 770 aa  249  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  30.2 
 
 		 778 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  31.44 
 
 		 825 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  31.38 
 
 		 710 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  29.17 
 
 		 828 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 702 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  30.97 
 
 		 702 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  31.65 
 
 		 850 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  30.47 
 
 		 701 aa  244  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  29.92 
 
 		 701 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  29.58 
 
 		 743 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  31.02 
 
 		 741 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  29.66 
 
 		 736 aa  241  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 701 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 701 aa  240  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 		 862 aa  239  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  30.1 
 
 		 726 aa  239  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  30.91 
 
 		 817 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>