More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2329 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2329  50S ribosomal protein L13P  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.0000000142062  hitchhiker  0.0000169503 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2099  50S ribosomal protein L13P  73.12 
 
 		 186 aa  292  2e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0695  50S ribosomal protein L13P  73.66 
 
 		 185 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.255324  normal  0.102804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1971  50S ribosomal protein L13P  74.43 
 
 		 182 aa  278  4e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00936727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1873  50S ribosomal protein L13P  52.81 
 
 		 179 aa  193  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.201339 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0278  ribosomal protein L13  50 
 
 		 154 aa  128  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04202  RL16_NEUCR 60S ribosomal protein L16Ribosomal protein L16a ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVN8]  41.55 
 
 		 202 aa  91.3  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.880107 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0482  ribosomal protein L13  35.37 
 
 		 136 aa  89.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1427  50S ribosomal protein L13P  34.69 
 
 		 140 aa  88.6  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0334284 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2389  50S ribosomal protein L13P  35.62 
 
 		 139 aa  85.5  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000134851  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1821  50S ribosomal protein L13P  34.48 
 
 		 149 aa  84.3  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1050  ribosomal protein L13  34.03 
 
 		 149 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0675751  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69349  60S large subunit ribosomal protein  37.09 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0426  50S ribosomal protein L13  35.17 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0183666 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0635  50S ribosomal protein L13P  41.24 
 
 		 137 aa  82  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2594  50S ribosomal protein L13P  33.79 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.342919  normal  0.0970947 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2549  ribosomal protein L13  38.02 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02320  structural constituent of ribosome, putative  36.54 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0388877  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1096  50S ribosomal protein L13P  32.65 
 
 		 138 aa  80.5  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0425  ribosomal protein L13  38.89 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1475  ribosomal protein L13  34.4 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1349  50S ribosomal protein L13P  41.24 
 
 		 137 aa  78.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.499454  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0269  50S ribosomal protein L13P  43 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2143  50S ribosomal protein L13P  33.78 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000325163  hitchhiker  0.000323505 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0569  50S ribosomal protein L13P  43 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.396644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2383  50S ribosomal protein L13P  38.05 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000110555  normal  0.666425 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2897  50S ribosomal protein L13P  39.09 
 
 		 140 aa  77.4  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0230753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2519  50S ribosomal protein L13P  39.81 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.594581  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1242  50S ribosomal protein L13P  30.82 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0012994  normal  0.58635 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2220  50S ribosomal protein L13P  33.56 
 
 		 140 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26899  Ribosomal protein L13a, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.01 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0138567  normal  0.0149822 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1805  50S ribosomal protein L13P  35.78 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.602671  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0737  50S ribosomal protein L13  37.17 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.664104  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0911  50S ribosomal protein L13  36.28 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0876  50S ribosomal protein L13  34.21 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00520364  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0789  50S ribosomal protein L13  34.21 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25375  predicted protein  29.07 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1827  50S ribosomal protein L13  36.28 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000510048  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1473  50S ribosomal protein L13  35.4 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00205276  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1653  50S ribosomal protein L13  35.4 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  33.93 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0387  50S ribosomal protein L13  35.4 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0384  50S ribosomal protein L13  35.4 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.618287  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2586  50S ribosomal protein L13  33.83 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  36.21 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3086  50S ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000435691  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  33.93 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  37.07 
 
 		 143 aa  53.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000118039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  33.04 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  36.84 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  33.93 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  34.78 
 
 		 144 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  32.79 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15678  Plastid ribosomal protein L13 large ribosomal subunit  36.28 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0368905  hitchhiker  0.00903198 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  36.97 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3191  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 142 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000050014  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  36.97 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3730  50S ribosomal protein L13  36.51 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  36.59 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3797  50S ribosomal protein L13  32.58 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000189229  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  33.61 
 
 		 145 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3711  50S ribosomal protein L13  34.82 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.145139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  33.57 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4027  ribosomal protein L13  35.29 
 
 		 149 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.353681  normal  0.240454 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  32.76 
 
 		 144 aa  51.6  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0561  50S ribosomal protein L13  33.91 
 
 		 142 aa  51.6  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000224516  normal  0.196899 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04010  50S ribosomal protein L13  36.84 
 
 		 142 aa  52  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 143 aa  51.6  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0718  50S ribosomal protein L13  32.35 
 
 		 151 aa  51.6  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000264986  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1682  50S ribosomal protein L13  35.29 
 
 		 154 aa  51.6  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124683  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13480  50S ribosomal protein L13  34.07 
 
 		 147 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00156161  hitchhiker  0.000481946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  38.46 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0401  50S ribosomal protein L13  31.25 
 
 		 149 aa  51.2  0.000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  32.14 
 
 		 143 aa  51.2  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  31.71 
 
 		 147 aa  51.2  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  37.69 
 
 		 142 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  36.61 
 
 		 145 aa  51.2  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  31.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  32.59 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3639  50S ribosomal protein L13  31.82 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0081105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  31.85 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  37.69 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1134  50S ribosomal protein L13  32.59 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  33.33 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1322  50S ribosomal protein L13  35.38 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0459  50S ribosomal protein L13  32.59 
 
 		 142 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000127467  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  35.04 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>