More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02690 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  55.9 
 
 		 729 aa  739    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  56.56 
 
 		 724 aa  784    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  56.76 
 
 		 724 aa  779    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  56.5 
 
 		 710 aa  747    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  55.61 
 
 		 710 aa  738    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  55.65 
 
 		 712 aa  736    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  100 
 
 		 704 aa  1421    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  49.13 
 
 		 751 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  48.48 
 
 		 743 aa  619  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  48.07 
 
 		 743 aa  619  1e-176  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  46.65 
 
 		 729 aa  620  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  48.02 
 
 		 743 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  47.84 
 
 		 743 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  47.88 
 
 		 743 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  47.88 
 
 		 743 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  37.6 
 
 		 719 aa  427  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  32.68 
 
 		 729 aa  328  2.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1495  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.56 
 
 		 711 aa  308  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.454643 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  30.14 
 
 		 698 aa  253  9.000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 716 aa  247  6e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  31.02 
 
 		 705 aa  243  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 708 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 728 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 811 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 774 aa  226  9e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 718 aa  225  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  28.25 
 
 		 706 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 811 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 702 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 727 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  29.28 
 
 		 738 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 727 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  28.43 
 
 		 707 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 707 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 707 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 754 aa  207  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  30.36 
 
 		 730 aa  207  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 702 aa  207  6e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 742 aa  204  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 728 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 715 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  26.58 
 
 		 730 aa  198  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  28.84 
 
 		 729 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 726 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  26.91 
 
 		 744 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  28.02 
 
 		 737 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  27.85 
 
 		 819 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  28.32 
 
 		 746 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  25.86 
 
 		 768 aa  191  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 757 aa  190  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.06 
 
 		 742 aa  190  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  27.95 
 
 		 805 aa  190  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 727 aa  189  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 726 aa  189  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  27.91 
 
 		 685 aa  188  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 708 aa  187  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  24.9 
 
 		 729 aa  187  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  26.71 
 
 		 762 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 750 aa  185  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  25.93 
 
 		 777 aa  185  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 728 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 809 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  26.48 
 
 		 761 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  26.63 
 
 		 753 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  26.05 
 
 		 802 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 737 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 772 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 772 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  26.9 
 
 		 734 aa  180  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 801 aa  180  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 801 aa  180  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 722 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  27.38 
 
 		 800 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 710 aa  178  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  24.97 
 
 		 755 aa  177  7e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  26.17 
 
 		 728 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  28.49 
 
 		 709 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 725 aa  174  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  26.9 
 
 		 804 aa  173  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 731 aa  171  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 729 aa  170  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 804 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  26.76 
 
 		 804 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  25.67 
 
 		 700 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4483  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 		 712 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000188322  hitchhiker  0.0000171512 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  26.06 
 
 		 730 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  24.28 
 
 		 772 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 378 aa  164  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  25.64 
 
 		 746 aa  163  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  25.25 
 
 		 771 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 		 808 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  26.1 
 
 		 714 aa  163  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  26.01 
 
 		 724 aa  162  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 758 aa  161  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  25.89 
 
 		 749 aa  161  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  27.36 
 
 		 701 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 710 aa  157  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 702 aa  157  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  26.25 
 
 		 823 aa  157  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  26.2 
 
 		 712 aa  157  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>