126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4226 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  68.24 
 
 		 176 aa  245  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  57.39 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  53.71 
 
 		 177 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  57.23 
 
 		 178 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  57.31 
 
 		 184 aa  199  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  54.8 
 
 		 165 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  54.24 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  53.22 
 
 		 175 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  54.24 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  53.67 
 
 		 165 aa  195  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  54.24 
 
 		 165 aa  194  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  53.33 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  185  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  49.13 
 
 		 178 aa  184  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  50.62 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  50.6 
 
 		 163 aa  181  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  47.56 
 
 		 184 aa  177  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  52.12 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  45.88 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  49.68 
 
 		 161 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  49.4 
 
 		 178 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  48.19 
 
 		 176 aa  171  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  44.44 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  45.71 
 
 		 178 aa  164  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  48.28 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  47.43 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  47.27 
 
 		 159 aa  158  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  41.46 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  41.52 
 
 		 191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  43.2 
 
 		 187 aa  137  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  45.04 
 
 		 133 aa  137  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  42.6 
 
 		 187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  36.09 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  39.05 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  35.12 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3154  hypothetical protein  58.73 
 
 		 58 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0787684 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  32.88 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  33.77 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  29.05 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  33.04 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  29.86 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  27.59 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  27.01 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  29.5 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  29.5 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  30.71 
 
 		 151 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  28.17 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  27.97 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0301  hypothetical protein  46.81 
 
 		 91 aa  51.6  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33350  hypothetical protein  66.67 
 
 		 38 aa  51.2  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1888b  hypothetical protein  47.83 
 
 		 101 aa  51.2  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  26.62 
 
 		 150 aa  51.2  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  31.51 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  27.86 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  32 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  22.64 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  32.38 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  31 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  27.63 
 
 		 240 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0568  hypothetical protein  29.51 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  25 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  26.71 
 
 		 234 aa  48.5  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1685  hypothetical protein  21.9 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  21.25 
 
 		 187 aa  47.8  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  26.09 
 
 		 152 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  33.05 
 
 		 158 aa  47.8  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  31.87 
 
 		 1372 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  29.47 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  24.56 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0607  hypothetical protein  28.69 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  26.53 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.97 
 
 		 1345 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  24.83 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  26.99 
 
 		 249 aa  46.6  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  28.1 
 
 		 218 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  28.78 
 
 		 153 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  27.05 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  26.11 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  27.05 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0148  transposase  25.21 
 
 		 236 aa  45.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0526667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  24.31 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3026  hypothetical protein  44.44 
 
 		 76 aa  45.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1423  protein of unknown function DUF1568  27.46 
 
 		 180 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7985800000000005e-18 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0837  hypothetical protein  27.44 
 
 		 206 aa  45.1  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  25.16 
 
 		 201 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  25.97 
 
 		 313 aa  45.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3248  protein of unknown function DUF1568  26.01 
 
 		 181 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00178625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  26.76 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  24.3 
 
 		 236 aa  44.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  24.78 
 
 		 224 aa  44.7  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  21.92 
 
 		 323 aa  44.3  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1967  hypothetical protein  25.62 
 
 		 282 aa  44.3  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.969925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0136  transposase  23.26 
 
 		 236 aa  44.3  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  21.92 
 
 		 241 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1392  hypothetical protein  26.03 
 
 		 320 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0315  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>