More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2861 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 544 aa  1087    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3699  methyl-accepting chemotaxis protein  68.75 
 
 		 543 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  68.27 
 
 		 543 aa  713    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  93.01 
 
 		 544 aa  996    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  66.36 
 
 		 544 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  72.06 
 
 		 569 aa  757    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  99.26 
 
 		 544 aa  1076    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  97.43 
 
 		 544 aa  1005    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  41.27 
 
 		 545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.12 
 
 		 548 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  40.22 
 
 		 556 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  40.49 
 
 		 549 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  38.85 
 
 		 540 aa  355  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3394  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.93 
 
 		 664 aa  346  7e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000171268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  36.18 
 
 		 546 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.56 
 
 		 546 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.02 
 
 		 564 aa  321  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.16 
 
 		 548 aa  320  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000213036  normal  0.437149 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 		 549 aa  320  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 		 548 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2327  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 		 554 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.644098  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0877  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 540 aa  313  6.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.11332 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  34.17 
 
 		 549 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.36 
 
 		 566 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.68 
 
 		 548 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.224982  normal  0.210295 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 566 aa  300  4e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2728  chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 544 aa  296  6e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00837045  normal  0.306222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.31 
 
 		 570 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 		 585 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.82 
 
 		 555 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  40 
 
 		 559 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.71 
 
 		 554 aa  286  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.86 
 
 		 569 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.72 
 
 		 545 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.71 
 
 		 554 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.72 
 
 		 545 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 		 554 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.71 
 
 		 554 aa  282  1e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.11 
 
 		 560 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1078  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.12 
 
 		 587 aa  281  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.62 
 
 		 554 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.27 
 
 		 554 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0990388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.42 
 
 		 554 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.42 
 
 		 554 aa  278  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.53 
 
 		 568 aa  277  4e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  33.14 
 
 		 554 aa  277  4e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.23 
 
 		 554 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4188  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.44 
 
 		 566 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210427  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.94 
 
 		 554 aa  274  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.16 
 
 		 545 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 554 aa  272  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.04 
 
 		 526 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.25 
 
 		 554 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.52 
 
 		 554 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3775  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.14 
 
 		 526 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.46 
 
 		 533 aa  270  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 		 568 aa  270  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.66 
 
 		 545 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.16 
 
 		 545 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.26 
 
 		 584 aa  267  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 554 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.16 
 
 		 545 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.64 
 
 		 533 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.64 
 
 		 533 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.98 
 
 		 554 aa  266  8e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  31.71 
 
 		 553 aa  266  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.66 
 
 		 554 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.98 
 
 		 545 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.98 
 
 		 545 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 		 554 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 554 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6950  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  31.65 
 
 		 661 aa  264  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  31.07 
 
 		 545 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.06 
 
 		 554 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  42.36 
 
 		 712 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05691  histidine kinase  32.23 
 
 		 538 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0673  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.39 
 
 		 533 aa  261  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.16 
 
 		 545 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  39.57 
 
 		 561 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  38.51 
 
 		 561 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.73 
 
 		 584 aa  260  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  41.98 
 
 		 712 aa  259  8e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.64 
 
 		 533 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.46 
 
 		 678 aa  259  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195593 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.55 
 
 		 519 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  37.45 
 
 		 560 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.52 
 
 		 526 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734846  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05646  histidine kinase  34.86 
 
 		 482 aa  258  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  40.25 
 
 		 713 aa  257  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.64 
 
 		 558 aa  256  6e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0868  methyl-accepting chemotaxis protein  33.52 
 
 		 536 aa  256  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000231989  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  30.62 
 
 		 564 aa  256  8e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  31.71 
 
 		 553 aa  254  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.47 
 
 		 585 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2874  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 		 563 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.872696  normal  0.485865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 		 541 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238907  normal  0.0164957 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.72 
 
 		 558 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.85 
 
 		 544 aa  252  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116754  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.95 
 
 		 563 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0122  methyl-accepting chemotaxis protein  32.68 
 
 		 553 aa  250  6e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>