More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1065 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 157 aa  317  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  91.08 
 
 		 157 aa  298  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  89.81 
 
 		 157 aa  295  1e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  82.17 
 
 		 157 aa  267  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  57.79 
 
 		 158 aa  189  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15331  Holliday junction resolvase  64.96 
 
 		 154 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0699  Holliday junction resolvase  63.5 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08941  Holliday junction resolvase  62.04 
 
 		 154 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1953  Holliday junction resolvase  59.85 
 
 		 154 aa  177  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.464779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0712  Holliday junction resolvase  60.58 
 
 		 154 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0918  Holliday junction resolvase  48.18 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  45.33 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4457  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.21 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  39.22 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.67 
 
 		 165 aa  124  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0115  Holliday junction resolvase  43.84 
 
 		 163 aa  123  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.44178 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.04 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.61 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3620  Holliday junction resolvase  44.83 
 
 		 163 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0798  Holliday junction resolvase  45.07 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.06 
 
 		 189 aa  120  6e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.79 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  40.71 
 
 		 168 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  38.71 
 
 		 166 aa  114  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.61 
 
 		 157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  40.71 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.96 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.75 
 
 		 200 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.06 
 
 		 178 aa  111  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.84 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  39.22 
 
 		 162 aa  110  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  41.83 
 
 		 172 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  39.72 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  43.97 
 
 		 163 aa  107  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  35.1 
 
 		 159 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1217  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.39 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.331391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.1 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.67 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.14 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 168 aa  104  6e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.67 
 
 		 191 aa  103  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.54 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  35.67 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.69 
 
 		 191 aa  100  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  36.88 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.47 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.97 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  33.97 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.44 
 
 		 165 aa  99  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  34.19 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  33.99 
 
 		 181 aa  98.6  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  34.59 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  35.06 
 
 		 181 aa  97.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  39.01 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  33.77 
 
 		 169 aa  97.8  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.87 
 
 		 176 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.18 
 
 		 172 aa  97.1  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.31 
 
 		 165 aa  97.1  9e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  35.1 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2726  Holliday junction resolvase  36.89 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  38.37 
 
 		 180 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  32.47 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12860  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.67 
 
 		 174 aa  96.3  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  33.96 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  33.77 
 
 		 181 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  36.31 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  33.77 
 
 		 181 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6909  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.293196 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  32.45 
 
 		 173 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  33.11 
 
 		 181 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3523  Holliday junction resolvase  36.07 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0543  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.42 
 
 		 186 aa  95.5  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  31.58 
 
 		 187 aa  94.7  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.87 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  33.76 
 
 		 192 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  33.76 
 
 		 192 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  35.48 
 
 		 182 aa  94.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.68 
 
 		 202 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35 
 
 		 170 aa  94.4  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.72 
 
 		 171 aa  94.4  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.84 
 
 		 192 aa  94  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.33 
 
 		 166 aa  94  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  32.72 
 
 		 183 aa  94  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  34.81 
 
 		 174 aa  93.6  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  35.71 
 
 		 171 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0002  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.33 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.075802  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0361  Holliday junction resolvase  39.72 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  35.76 
 
 		 180 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0343  Holliday junction resolvase  39.72 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  32.9 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1250  Holliday junction resolvase  34.81 
 
 		 174 aa  92  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3828  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.75 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  30.26 
 
 		 187 aa  91.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.99 
 
 		 182 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>