More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1953 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1953  Holliday junction resolvase  100 
 
 
154 aa  312  8e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.464779  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0712  Holliday junction resolvase  84.42 
 
 
154 aa  242  9.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08941  Holliday junction resolvase  80.52 
 
 
154 aa  236  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  70.13 
 
 
158 aa  228  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  61.74 
 
 
157 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15331  Holliday junction resolvase  63.5 
 
 
154 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0699  Holliday junction resolvase  62.04 
 
 
154 aa  194  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  59.73 
 
 
157 aa  193  9e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  60.4 
 
 
157 aa  192  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  58.39 
 
 
157 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0918  Holliday junction resolvase  53.25 
 
 
157 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0115  Holliday junction resolvase  52.83 
 
 
163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.44178 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3620  Holliday junction resolvase  47.59 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4457  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.63 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0798  Holliday junction resolvase  51.92 
 
 
161 aa  130  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  45.71 
 
 
168 aa  126  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  37.91 
 
 
164 aa  124  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  41.61 
 
 
161 aa  123  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.62 
 
 
165 aa  123  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.71 
 
 
164 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  42.28 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  41.22 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 
182 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  42.14 
 
 
168 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 
162 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  41.84 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.3 
 
 
164 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  42.55 
 
 
172 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.13 
 
 
166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.27 
 
 
163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  42.55 
 
 
164 aa  107  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 
159 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  39.72 
 
 
165 aa  105  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.24 
 
 
157 aa  105  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.82 
 
 
179 aa  105  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.3 
 
 
200 aa  104  4e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38 
 
 
163 aa  103  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  38.93 
 
 
181 aa  102  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.22 
 
 
178 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.86 
 
 
165 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.3 
 
 
192 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1217  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.42 
 
 
164 aa  101  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.331391  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  39.33 
 
 
181 aa  101  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  38.26 
 
 
181 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  38.26 
 
 
181 aa  100  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.57 
 
 
192 aa  100  9e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  36.17 
 
 
157 aa  100  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.25 
 
 
184 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 
181 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  38.26 
 
 
164 aa  97.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.25 
 
 
162 aa  97.8  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.3 
 
 
171 aa  96.7  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 
192 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 
192 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  39.47 
 
 
183 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  38.26 
 
 
164 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  38.26 
 
 
164 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  38 
 
 
169 aa  94.4  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2373  Holliday junction resolvase  37.69 
 
 
188 aa  94.4  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  30.67 
 
 
158 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.77 
 
 
160 aa  94  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.36 
 
 
191 aa  93.6  9e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  36.91 
 
 
164 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  38.31 
 
 
180 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 
183 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2011  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.67 
 
 
164 aa  92.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 
180 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  31.58 
 
 
202 aa  92  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 
180 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 
180 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  35.76 
 
 
168 aa  91.7  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 
180 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 
180 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.43 
 
 
170 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 
180 aa  91.3  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  33.78 
 
 
173 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 
172 aa  90.5  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  38.26 
 
 
180 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3409  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 
182 aa  90.5  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.102403  normal  0.125842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  38.26 
 
 
180 aa  90.5  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 
284 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.33 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  38.93 
 
 
180 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.42 
 
 
191 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  40 
 
 
180 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 
275 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  38.22 
 
 
186 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.12 
 
 
190 aa  89  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  34.19 
 
 
180 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  37.58 
 
 
186 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  29.73 
 
 
189 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  38 
 
 
180 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  38 
 
 
180 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2207  crossover junction endodeoxyribonuclease  35.48 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00329644  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0028  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  29.53 
 
 
156 aa  88.2  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3523  Holliday junction resolvase  35.77 
 
 
178 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>