More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0343 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0361  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 165 aa  338  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0343  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 165 aa  338  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  58.97 
 
 		 157 aa  190  9e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.31 
 
 		 165 aa  169  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.73 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.97 
 
 		 163 aa  166  9e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  56.86 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  51.32 
 
 		 165 aa  162  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  48.68 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  46.84 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  47.17 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  51.97 
 
 		 159 aa  157  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  46.79 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  46.71 
 
 		 182 aa  154  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  46.15 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  47.68 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.03 
 
 		 167 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.81 
 
 		 160 aa  147  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  48.03 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  51.32 
 
 		 164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  51.32 
 
 		 165 aa  144  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  47.77 
 
 		 164 aa  144  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  47.13 
 
 		 171 aa  141  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  48.65 
 
 		 157 aa  140  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  52.63 
 
 		 163 aa  140  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.68 
 
 		 184 aa  137  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.75 
 
 		 167 aa  137  7e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 		 164 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.51 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.36 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.77 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  45.7 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  46.01 
 
 		 168 aa  134  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 181 aa  134  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.32 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.4 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 180 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.74 
 
 		 182 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  43.51 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  43.04 
 
 		 180 aa  130  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  45.27 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 		 180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 275 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  43.79 
 
 		 284 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.53 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  42.48 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  42.48 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  45.03 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  45.4 
 
 		 168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  45.27 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.95 
 
 		 192 aa  127  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 		 180 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 		 182 aa  127  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  39.13 
 
 		 180 aa  127  8.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 		 158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  42.21 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  42.48 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  37.89 
 
 		 200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.45 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  42.57 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  41.33 
 
 		 173 aa  123  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  45.27 
 
 		 169 aa  123  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  41.51 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.47 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  40.59 
 
 		 173 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  40.24 
 
 		 168 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1217  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.25 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.331391  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  40.62 
 
 		 186 aa  120  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  41.98 
 
 		 182 aa  120  8e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 186 aa  120  9e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.84 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  40.38 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  39.13 
 
 		 182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.4 
 
 		 173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.22 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.33 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01556  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 174 aa  118  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  38.46 
 
 		 182 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  39.13 
 
 		 182 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0838  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.94 
 
 		 193 aa  117  7e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>