More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_08941 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_08941  Holliday junction resolvase  100 
 
 		 154 aa  313  8e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0712  Holliday junction resolvase  87.01 
 
 		 154 aa  253  6e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  73.38 
 
 		 158 aa  237  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1953  Holliday junction resolvase  80.52 
 
 		 154 aa  233  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.464779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  64.43 
 
 		 157 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  62.42 
 
 		 157 aa  197  5e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15331  Holliday junction resolvase  64.29 
 
 		 154 aa  196  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0699  Holliday junction resolvase  64.29 
 
 		 154 aa  196  9e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  61.74 
 
 		 157 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  60.4 
 
 		 157 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0918  Holliday junction resolvase  53.25 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0115  Holliday junction resolvase  50.94 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.44178 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0798  Holliday junction resolvase  53.21 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4457  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50.94 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3620  Holliday junction resolvase  46.9 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  43.92 
 
 		 164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.38 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 182 aa  124  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42 
 
 		 165 aa  120  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  37.84 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  38.67 
 
 		 161 aa  118  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.6 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  41.43 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  40.71 
 
 		 168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  43.26 
 
 		 172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 165 aa  110  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.89 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  36 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.41 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.22 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.33 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.01 
 
 		 166 aa  106  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  36 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  38.3 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.93 
 
 		 165 aa  103  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.87 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.91 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  40.43 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.33 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  38 
 
 		 181 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  39.01 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  39.72 
 
 		 192 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  36 
 
 		 159 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.33 
 
 		 192 aa  101  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  40.91 
 
 		 180 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1217  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.42 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.331391  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.01 
 
 		 192 aa  100  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 180 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.59 
 
 		 200 aa  99.4  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  39.01 
 
 		 192 aa  98.6  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  38 
 
 		 181 aa  97.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  36 
 
 		 181 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  37.42 
 
 		 180 aa  97.8  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.14 
 
 		 170 aa  97.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.72 
 
 		 171 aa  97.1  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 180 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2011  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.29 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.55 
 
 		 202 aa  96.3  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 		 180 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 		 180 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  34.9 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  37.33 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.76 
 
 		 172 aa  95.5  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  36 
 
 		 181 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  40.94 
 
 		 180 aa  95.5  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  36.67 
 
 		 181 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  38.93 
 
 		 180 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 275 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 284 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 		 180 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 		 180 aa  93.2  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  35.33 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  36.91 
 
 		 183 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.17 
 
 		 199 aa  92  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2207  crossover junction endodeoxyribonuclease  34.19 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00329644  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2373  Holliday junction resolvase  36.92 
 
 		 188 aa  92.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.511513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  38.56 
 
 		 182 aa  92  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  35.33 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  35.33 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.14 
 
 		 184 aa  92  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  31.82 
 
 		 160 aa  91.3  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  35.33 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0028  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  29.03 
 
 		 156 aa  90.9  5e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.67 
 
 		 191 aa  90.9  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.67 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  36.94 
 
 		 183 aa  90.1  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1573  Holliday junction resolvase  30 
 
 		 158 aa  89.4  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  32.89 
 
 		 168 aa  89.4  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  31.37 
 
 		 200 aa  89.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>