More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0798 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0798  Holliday junction resolvase  100 
 
 
161 aa  320  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0918  Holliday junction resolvase  67.5 
 
 
157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0115  Holliday junction resolvase  65.43 
 
 
163 aa  186  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.44178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4457  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  63.01 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3620  Holliday junction resolvase  58.9 
 
 
163 aa  175  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  49.03 
 
 
158 aa  145  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  47.68 
 
 
157 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  47.68 
 
 
157 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.95 
 
 
164 aa  142  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  45.51 
 
 
157 aa  141  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  45.7 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0712  Holliday junction resolvase  53.21 
 
 
154 aa  138  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08941  Holliday junction resolvase  53.21 
 
 
154 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.34 
 
 
165 aa  134  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.67 
 
 
167 aa  132  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1953  Holliday junction resolvase  51.92 
 
 
154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.464779  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  46.67 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  43.05 
 
 
182 aa  127  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  44 
 
 
156 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  42 
 
 
166 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  46.48 
 
 
165 aa  122  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48 
 
 
164 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  46 
 
 
165 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15331  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 
154 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 
162 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0699  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 
154 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.85 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.53 
 
 
171 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.67 
 
 
179 aa  117  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  37.18 
 
 
158 aa  117  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  46 
 
 
159 aa  117  9e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  44.83 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  45.45 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.25 
 
 
200 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  45.39 
 
 
168 aa  111  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  45.45 
 
 
164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.31 
 
 
162 aa  107  9.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  42.25 
 
 
163 aa  105  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6113  Crossover junction endodeoxyribonuclease  43.26 
 
 
200 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0688405 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.49 
 
 
167 aa  103  8e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.4 
 
 
165 aa  101  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  40.4 
 
 
165 aa  101  5e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  45.03 
 
 
183 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.74 
 
 
165 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.45 
 
 
184 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.85 
 
 
192 aa  99  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.71 
 
 
160 aa  97.1  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 
164 aa  96.3  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
180 aa  95.5  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  41.03 
 
 
180 aa  95.5  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 
180 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 
180 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34 
 
 
189 aa  95.1  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.62 
 
 
202 aa  95.1  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.41 
 
 
178 aa  94.7  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.91 
 
 
157 aa  95.1  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 
180 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 
181 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.54 
 
 
182 aa  94.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 
180 aa  94.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 
180 aa  94  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0343  Holliday junction resolvase  41.55 
 
 
165 aa  94  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0361  Holliday junction resolvase  41.55 
 
 
165 aa  94  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  39.47 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
180 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
180 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
180 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
180 aa  93.2  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
180 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 
180 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
275 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
284 aa  92.4  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1992  Holliday junction resolvase  41.55 
 
 
199 aa  91.7  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 
164 aa  91.7  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  41.06 
 
 
180 aa  91.3  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0833  Holliday junction resolvase  40 
 
 
182 aa  90.5  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0886896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  39.35 
 
 
182 aa  90.5  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2300  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.86 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2011  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.31 
 
 
164 aa  89  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2385  Holliday junction endonuclease RuvC  40.43 
 
 
177 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  38.31 
 
 
182 aa  87.8  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  31.41 
 
 
200 aa  87.8  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0028  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  29.94 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1217  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.31 
 
 
164 aa  87  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.331391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  37.09 
 
 
181 aa  87  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  40.65 
 
 
182 aa  86.7  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  33.58 
 
 
174 aa  87  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.32 
 
 
172 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.14 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04920  Holliday junction resolvase  30.97 
 
 
184 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>