More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33477 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_33477  DRAP deaminase  100 
 
 
585 aa  1218    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.261571 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10936  DRAP deaminase (Rib2), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G16360)  52.04 
 
 
572 aa  338  9.999999999999999e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.292006 
 
 
-
 
NC_006686  CND02470  conserved hypothetical protein  49.26 
 
 
520 aa  269  8.999999999999999e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0281406  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14067  predicted protein  40.6 
 
 
271 aa  201  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.952518  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61490  DRAP deaminase and pseudouridylate synthase  36.08 
 
 
425 aa  188  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_4215  predicted protein  31.68 
 
 
357 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  38.42 
 
 
623 aa  137  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10900  pseudouridine synthase, RluA family  33.58 
 
 
320 aa  124  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.631494  unclonable  0.00000000285325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4953  pseudouridine synthase, RluA family  31.6 
 
 
369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1591  pseudouridine synthase, RluA family  33.33 
 
 
370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  decreased coverage  0.00904495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1919  pseudouridine synthase, RluA family  33.33 
 
 
370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338974  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8859  predicted protein  37.5 
 
 
168 aa  120  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00776718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3242  pseudouridine synthase, RluA family  34.04 
 
 
303 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.341693  normal  0.607359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  33.07 
 
 
431 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  34.96 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  33.47 
 
 
400 aa  118  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.54 
 
 
438 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1628  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D protein  32.94 
 
 
358 aa  117  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.6 
 
 
391 aa  117  7.999999999999999e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1014  pseudouridylate synthase, 23S RNA-specific  33.06 
 
 
304 aa  117  7.999999999999999e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000716198  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  33.76 
 
 
302 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1491  pseudouridine synthase, RluA family protein  32.35 
 
 
318 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.446351  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  31.87 
 
 
436 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  32.27 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2503  RluA family pseudouridine synthase  31.5 
 
 
319 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.721496  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.67 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  32.67 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2404  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.38 
 
 
329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151583  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2474  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.38 
 
 
329 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0799284  normal  0.0195489 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  32.27 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  32.67 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.65 
 
 
300 aa  115  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0921  RluA family pseudouridine synthase  33.07 
 
 
318 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1708  RluA family pseudouridine synthase  33.09 
 
 
329 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000190104  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1711  RluA family pseudouridine synthase  33.09 
 
 
329 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334248  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09471  DRAP deaminase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13200)  37.08 
 
 
222 aa  114  6e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2656  pseudouridine synthase, RluA family  33.09 
 
 
319 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0425559  hitchhiker  0.000122586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1574  RluA family pseudouridine synthase  32.86 
 
 
330 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00553384  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1817  RluA family pseudouridine synthase  32.14 
 
 
360 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1751  RluA family pseudouridine synthase  34.48 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000123206  normal  0.30128 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03674  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  38.38 
 
 
250 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  32.13 
 
 
306 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2566  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.03 
 
 
329 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00643292  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1344  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.59 
 
 
403 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0022  RNA pseudouridylate synthase family protein  33.62 
 
 
300 aa  112  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0596  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.05 
 
 
308 aa  111  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000579613  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0318  RluA  31.54 
 
 
299 aa  111  3e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264747  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2301  pseudouridine synthase, RluD  30.77 
 
 
318 aa  111  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0049  RNA pseudouridine synthase family protein  33.93 
 
 
300 aa  112  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0921  pseudouridine synthase, RluA family  32.68 
 
 
344 aa  111  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1589  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  30.77 
 
 
308 aa  111  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0462053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2104  RluA family pseudouridine synthase  35.56 
 
 
306 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.74 
 
 
304 aa  111  4.0000000000000004e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  36.46 
 
 
318 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.96 
 
 
300 aa  110  9.000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  33.2 
 
 
305 aa  110  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1324  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.35 
 
 
395 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2333  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.35 
 
 
395 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2303  RluA family pseudouridine synthase  35.91 
 
 
323 aa  110  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  35 
 
 
306 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1344  pseudouridine synthase, RluA family  30.43 
 
 
313 aa  109  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1084  RluA family pseudouridine synthase  31.35 
 
 
389 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.346306  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5026  RluA family pseudouridine synthase  33.08 
 
 
356 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.257508  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2094  pseudouridine synthase, RluD  32.26 
 
 
304 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0386  RluA family pseudouridine synthase  29.88 
 
 
303 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.34 
 
 
403 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.270637  normal  0.743014 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0083  RluA family pseudouridine synthase  31.35 
 
 
389 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4020  pseudouridine synthase, RluA family  31.36 
 
 
306 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2205  RluA family pseudouridine synthase  30.95 
 
 
395 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.55 
 
 
296 aa  108  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1174  RluA family pseudouridine synthase  30.43 
 
 
399 aa  109  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539633  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1865  RluA family pseudouridine synthase  33.6 
 
 
344 aa  109  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1813  RluA family pseudouridine synthase  31.35 
 
 
389 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587957  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2588  pseudouridine synthase, RluA family  28.57 
 
 
325 aa  108  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0671  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  31.03 
 
 
296 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.192683  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2168  RluA family pseudouridine synthase  30.95 
 
 
389 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09330  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.91 
 
 
308 aa  108  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00125155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  27.66 
 
 
326 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5191  pseudouridine synthase, RluA family  29.36 
 
 
308 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000721787 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0024  RNA pseudouridine synthase family protein  33.19 
 
 
300 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4787  RluA family pseudouridine synthase  29.48 
 
 
334 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.495822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3978  pseudouridine synthase, RluA family  30.93 
 
 
306 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1111  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.7 
 
 
343 aa  107  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.522532  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1818  RNA pseudouridine synthase  29.25 
 
 
319 aa  107  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1988  pseudouridylate synthase  30.4 
 
 
330 aa  107  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00771455  normal  0.0114075 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0480  RluA family pseudouridine synthase  32.48 
 
 
364 aa  107  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.632369  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1594  RluA family pseudouridine synthase  31.9 
 
 
329 aa  107  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260553  normal  0.0130241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2950  RluA family pseudouridine synthase  31 
 
 
310 aa  107  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1358  pseudouridine synthase, RluA family  33.47 
 
 
303 aa  107  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.364414  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0906  pseudouridine synthase, RluA family  28.17 
 
 
344 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447686  normal  0.0333397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08290  pseudouridine synthase, RluA family  31.37 
 
 
310 aa  106  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2815  23S rRNA pseudouridylate synthase C  32.16 
 
 
318 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000464709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  30.24 
 
 
299 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.14 
 
 
318 aa  106  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0971  pseudouridine synthase, RluA family  28.17 
 
 
344 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.158596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2615  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.85 
 
 
344 aa  105  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0357699  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2510  23S rRNA pseudouridylate synthase C  34.21 
 
 
318 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2642  pseudouridine synthase, RluA family  31.23 
 
 
339 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.704369  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0497  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.11 
 
 
325 aa  105  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2041  23S rRNA pseudouridylate synthase C  32.86 
 
 
319 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000773418  hitchhiker  0.000351853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>