173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_19661 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_19661  predicted protein  100 
 
 
319 aa  642    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.527645  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5914  predicted protein  44.94 
 
 
241 aa  196  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0219584  normal  0.0472601 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4082  phage shock protein A, PspA  41.06 
 
 
254 aa  191  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224572  hitchhiker  0.000308318 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3867  phage shock protein A, PspA  41 
 
 
255 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4081  phage shock protein A, PspA  41.06 
 
 
254 aa  186  4e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.537261  hitchhiker  0.00031127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0162  phage shock protein A, PspA  43.36 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807255  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4080  phage shock protein A, PspA  41.59 
 
 
221 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0588  membrane-associated 30 kD protein-like  45.22 
 
 
257 aa  177  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2144  phage shock protein A, PspA  41.73 
 
 
259 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.865725 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0794  membrane-associated 30 kD protein-like  44.59 
 
 
257 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3916  phage shock protein A, PspA  40.23 
 
 
255 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0260841  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1776  membrane-associated 30 kD protein-like  43.16 
 
 
257 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5100  phage shock protein A, PspA  41.51 
 
 
259 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.233513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0161  phage shock protein A, PspA  41.99 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877832  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06211  membrane-associated 30 kDa protein  42.49 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0405479 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04291  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  39.92 
 
 
282 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0913  phage shock protein A  37.79 
 
 
256 aa  153  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0914  phage shock protein A  38.49 
 
 
246 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04861  membrane-associated 30 kDa-like protein  40.44 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.151825  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1764  putative chloroplast membrane-associated 30 kD protein  39.47 
 
 
258 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.589216  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0487  phage shock protein A, PspA  33.77 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.496627  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1615  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 
225 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00247029 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  31.74 
 
 
222 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2942  phage shock protein A, PspA  31.86 
 
 
241 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.883284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0013  phage shock protein A, PspA  33.33 
 
 
220 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3176  phage shock protein A, PspA  30.97 
 
 
241 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0017  phage shock protein A, PspA  33.48 
 
 
220 aa  116  6e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.12234 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0996  phage shock protein A, PspA  35.2 
 
 
237 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.204828  normal  0.0136537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02833  phage shock protein A  31.38 
 
 
227 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20810  phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  29.69 
 
 
221 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.837208  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1807  phage shock protein A  30.43 
 
 
227 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2482  phage shock protein A, PspA  30.43 
 
 
227 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0189828 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2550  phage shock protein A, PspA  30.43 
 
 
227 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1237  phage shock protein A  30.58 
 
 
227 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2648  phage shock protein A, PspA  30.43 
 
 
227 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.511063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2669  phage shock protein A, PspA  29.31 
 
 
225 aa  102  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3100  phage shock protein A, PspA  29.31 
 
 
229 aa  102  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.640678  hitchhiker  0.0000229067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0384  phage shock protein A, PspA  29.69 
 
 
243 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.790128  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003814  phage shock protein A  32 
 
 
223 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.968962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1554  phage shock protein A, PspA  30.97 
 
 
227 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000370882 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2578  phage shock protein A, PspA  30.53 
 
 
227 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1502  phage shock protein A, PspA  31.2 
 
 
227 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1257  phage shock protein A, PspA  31.15 
 
 
238 aa  99.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1283  phage shock protein A  31.56 
 
 
222 aa  100  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1640  phage shock protein A, PspA  31.2 
 
 
227 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.695395  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3471  phage shock protein A, PspA  30.09 
 
 
250 aa  99.4  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2737  phage shock protein A, PspA  31.2 
 
 
227 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.282837  normal  0.137978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1156  phage shock protein A, PspA  29.17 
 
 
274 aa  99.4  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.366088  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1617  phage shock protein A, PspA  31.2 
 
 
227 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1606  phage shock protein A, PspA  31.2 
 
 
227 aa  99.4  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  29.2 
 
 
221 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1799  phage shock protein A, PspA  27.2 
 
 
243 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.867438 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01872  hypothetical protein  30.67 
 
 
223 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2624  phage shock protein PspA  27.43 
 
 
221 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377014  normal  0.46618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0179  phage shock protein A, PspA  28.82 
 
 
220 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4700  hypothetical protein  29.91 
 
 
221 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4540  phage shock protein A  29.91 
 
 
221 aa  96.3  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4557  phage shock protein A  29.91 
 
 
221 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5061  hypothetical protein  29.91 
 
 
221 aa  96.3  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4925  hypothetical protein  29.91 
 
 
221 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2496  phage shock protein A, PspA  29.73 
 
 
227 aa  96.3  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.307534  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0310  hypothetical protein  29.91 
 
 
221 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0607  phage shock protein A, PspA  30.86 
 
 
279 aa  95.9  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4929  hypothetical protein  29.91 
 
 
221 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2169  phage shock protein PspA  26.99 
 
 
222 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.985709  normal  0.0801185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4639  phage shock protein A, PspA  29.91 
 
 
221 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4961  hypothetical protein  29.46 
 
 
221 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4944  hypothetical protein  29.46 
 
 
221 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3772  phage shock protein A  29.65 
 
 
221 aa  93.6  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  27.43 
 
 
221 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  27.43 
 
 
221 aa  93.6  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03595  phage shock protein A  28.89 
 
 
222 aa  93.2  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0300107  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3083  phage shock protein A, PspA  30.3 
 
 
220 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249888  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1642  phage shock protein PspA  27.43 
 
 
222 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000040084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1876  phage shock protein PspA  27.43 
 
 
222 aa  92.4  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890059 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1814  phage shock protein PspA  27.43 
 
 
222 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000037249 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1460  phage shock protein PspA  27.43 
 
 
222 aa  92.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.404115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01281  regulatory protein for phage-shock-protein operon  27.43 
 
 
222 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2342  phage shock protein A, PspA  27.43 
 
 
222 aa  92  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00393606  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  29.92 
 
 
297 aa  92.4  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1218  phage shock protein A, PspA  28.44 
 
 
226 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.487101  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1815  phage shock protein PspA  27.88 
 
 
222 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.216453 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1419  phage shock protein PspA  27.43 
 
 
222 aa  92  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1514  phage shock protein PspA  27.43 
 
 
222 aa  92  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2321  phage shock protein PspA  27.43 
 
 
222 aa  92  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17031  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1818  phage shock protein PspA  27.43 
 
 
222 aa  92  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1946  phage shock protein PspA  27.43 
 
 
222 aa  92  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01292  hypothetical protein  27.43 
 
 
222 aa  92  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1540  phage shock protein PspA  27.43 
 
 
222 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2480  PspA/IM30  30.32 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1786  phage shock protein PspA  25.66 
 
 
221 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2537  phage shock protein PspA  25.66 
 
 
221 aa  90.5  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1894  phage shock protein PspA  25.66 
 
 
221 aa  90.1  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4044  phage shock protein A, PspA  31.31 
 
 
219 aa  90.1  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1391  phage shock protein A, PspA  29.3 
 
 
288 aa  89.7  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.267154  normal  0.145173 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0481  phage shock protein A  32.02 
 
 
221 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2937  phage shock protein A, PspA  27.52 
 
 
223 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0393136 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  28.32 
 
 
221 aa  86.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  29.13 
 
 
224 aa  86.3  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0207  phage shock protein A, PspA  29.07 
 
 
220 aa  85.9  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.761137  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>