103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12550 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  100 
 
 		 283 aa  566  1e-160  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  35.83 
 
 		 2491 aa  148  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  33.45 
 
 		 716 aa  143  4e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  34.17 
 
 		 526 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  34.74 
 
 		 601 aa  125  9e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  31.49 
 
 		 685 aa  122  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1196  predicted protein  32.87 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  33.47 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  33.33 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  29.51 
 
 		 640 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  31.5 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  29.97 
 
 		 447 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  34.38 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  33.7 
 
 		 1012 aa  109  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  31.18 
 
 		 1017 aa  109  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  33.77 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12909  predicted protein  29.36 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1389  predicted protein  29.67 
 
 		 334 aa  99.8  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000337906  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4339  predicted protein  32.21 
 
 		 222 aa  99.8  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00625498  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43724  predicted protein  29.41 
 
 		 890 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_1379  predicted protein  29.37 
 
 		 350 aa  96.3  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.815814  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  29.91 
 
 		 899 aa  92  9e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39117  predicted protein  27.69 
 
 		 587 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.294419  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  33.47 
 
 		 863 aa  89  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  34.75 
 
 		 1000 aa  85.5  9e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4344  predicted protein  35.5 
 
 		 169 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  32.31 
 
 		 482 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  35.22 
 
 		 1041 aa  81.3  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  37.81 
 
 		 867 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  32.21 
 
 		 354 aa  79  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_6311  predicted protein  37.17 
 
 		 127 aa  78.6  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  32.47 
 
 		 508 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11423  predicted protein  33.77 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.47 
 
 		 1107 aa  76.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1865  leucine-rich repeat-containing protein  37.32 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.956378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  35.07 
 
 		 892 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49769  predicted protein  32.26 
 
 		 593 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  29.36 
 
 		 454 aa  72.8  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49671  predicted protein  28.3 
 
 		 454 aa  72.8  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.245553  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44315  predicted protein  30.3 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.205581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.18 
 
 		 1263 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86229  predicted protein  27.31 
 
 		 497 aa  68.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  23.94 
 
 		 2324 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44441  predicted protein  27.54 
 
 		 4500 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  27.95 
 
 		 543 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  32.84 
 
 		 886 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33901  predicted protein  27.93 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.530565  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  28.52 
 
 		 757 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  34.16 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  33.33 
 
 		 1015 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  31.88 
 
 		 713 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46212  predicted protein  33.64 
 
 		 768 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18438  predicted protein  24.54 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15749  predicted protein  37.18 
 
 		 81 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00765977  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  27.62 
 
 		 648 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  31.11 
 
 		 972 aa  56.6  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  27.67 
 
 		 1749 aa  55.5  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31.84 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.75 
 
 		 937 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45679  predicted protein  26.83 
 
 		 682 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49666  predicted protein  26.91 
 
 		 540 aa  53.9  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.75 
 
 		 937 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  28.94 
 
 		 448 aa  53.1  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  30.12 
 
 		 1070 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  30.12 
 
 		 1070 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  26.9 
 
 		 1290 aa  52.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45682  predicted protein  28.38 
 
 		 633 aa  52.8  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  30.88 
 
 		 307 aa  52.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  27 
 
 		 440 aa  52.8  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38108  predicted protein  30.28 
 
 		 461 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  29.76 
 
 		 1112 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  27.11 
 
 		 1024 aa  48.9  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  28.76 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  26.7 
 
 		 925 aa  48.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  26.67 
 
 		 478 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  33.85 
 
 		 761 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  27.56 
 
 		 760 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  28.71 
 
 		 471 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1351 aa  45.8  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1508  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.61 
 
 		 653 aa  45.8  0.0009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.741418  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  30.3 
 
 		 1088 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  28.26 
 
 		 1344 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  29.45 
 
 		 434 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  28.79 
 
 		 467 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  29.48 
 
 		 2132 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1246  internalin  26.67 
 
 		 542 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  26.67 
 
 		 765 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4631  leucine-rich repeat-containing protein  28.87 
 
 		 473 aa  44.3  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.350249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28825  predicted protein  26.73 
 
 		 484 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.664736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  26.67 
 
 		 779 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  28.36 
 
 		 472 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02459  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G10390)  32.14 
 
 		 1780 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.186892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  26.67 
 
 		 755 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  25.61 
 
 		 204 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  27.54 
 
 		 476 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  26.67 
 
 		 766 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  29.46 
 
 		 528 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  32.16 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46793  predicted protein  33.33 
 
 		 329 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01870  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 		 840 aa  42.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>