More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3146 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3146  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 622 aa  1295    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.476414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3180  alpha amylase catalytic region  42.93 
 
 		 635 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000161809  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  40.26 
 
 		 562 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  32.69 
 
 		 582 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0802  glycosy hydrolase family protein  29.5 
 
 		 610 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.124248  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0789  cymH protein  29.29 
 
 		 610 aa  220  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  34.95 
 
 		 588 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  32.77 
 
 		 587 aa  216  7e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  33.41 
 
 		 589 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  34.16 
 
 		 586 aa  211  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  34.36 
 
 		 586 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  30.54 
 
 		 586 aa  208  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  30.97 
 
 		 586 aa  208  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  33.86 
 
 		 586 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  33.86 
 
 		 586 aa  207  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  33.86 
 
 		 586 aa  207  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  30.54 
 
 		 586 aa  206  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  33.86 
 
 		 586 aa  206  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  33.86 
 
 		 586 aa  206  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  30.75 
 
 		 586 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  32.24 
 
 		 574 aa  206  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  29.04 
 
 		 584 aa  205  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  31.46 
 
 		 477 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1944  alpha amylase catalytic region  30.86 
 
 		 486 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  30.35 
 
 		 575 aa  194  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1971  alpha amylase catalytic region  30.66 
 
 		 486 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.0160527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  32.68 
 
 		 586 aa  194  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  29.09 
 
 		 1401 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1998  alpha amylase catalytic region  30.8 
 
 		 481 aa  192  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.722533  normal  0.515841 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1318  alpha amylase catalytic region  31.26 
 
 		 486 aa  192  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.844059  normal  0.130735 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4343  alpha amylase catalytic region  29.55 
 
 		 481 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1458  alpha amylase, catalytic region  30.68 
 
 		 644 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.628846  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  30.8 
 
 		 493 aa  191  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  30.96 
 
 		 481 aa  191  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  27.5 
 
 		 1401 aa  190  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  29.49 
 
 		 589 aa  189  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0084  pullulanase  28.76 
 
 		 606 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  29.53 
 
 		 496 aa  184  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  32.08 
 
 		 583 aa  183  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  33.95 
 
 		 522 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  31.2 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0221  alpha amylase catalytic region  32.72 
 
 		 474 aa  181  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  31.11 
 
 		 510 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  29.95 
 
 		 1847 aa  180  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0987  alpha amylase catalytic region  32.55 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0969  alpha amylase, catalytic region  32.55 
 
 		 473 aa  179  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  30.71 
 
 		 511 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2092  alpha amylase catalytic subunit  31.28 
 
 		 484 aa  179  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0253645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0586  alpha amylase catalytic region  31.4 
 
 		 479 aa  179  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.532649  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4625  alpha amylase catalytic region  29.25 
 
 		 481 aa  177  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  30.02 
 
 		 1307 aa  177  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1313  alpha amylase, catalytic domain protein  30.73 
 
 		 459 aa  176  9e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  29.94 
 
 		 488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21691  glycoside hydrolase family protein  32.41 
 
 		 483 aa  174  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0470032 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  30.17 
 
 		 481 aa  173  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0215  neopullulanase  29.75 
 
 		 574 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0425343  hitchhiker  0.000179088 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1580  alpha amylase, catalytic region  31.59 
 
 		 475 aa  172  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0569736  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0475  alpha amylase, catalytic region  30.19 
 
 		 608 aa  170  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.350663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0534  alpha amylase catalytic region  30.25 
 
 		 487 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  0.941542 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1834  alpha amylase domain-containing protein  33.15 
 
 		 480 aa  170  7e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.108338  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  30.83 
 
 		 472 aa  169  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  30.27 
 
 		 593 aa  167  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0557  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  28.51 
 
 		 1175 aa  167  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.641532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  32.19 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  30.75 
 
 		 588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  32.98 
 
 		 595 aa  165  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  31.66 
 
 		 541 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  31.13 
 
 		 541 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  33.07 
 
 		 576 aa  163  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5858  alpha amylase catalytic region  31.36 
 
 		 569 aa  163  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.364305 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 914 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002973  maltodextrin glucosidase  28.63 
 
 		 608 aa  161  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  32.03 
 
 		 493 aa  161  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  32.55 
 
 		 499 aa  160  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  30.1 
 
 		 552 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  31.3 
 
 		 509 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0501  alpha amylase domain-containing protein  31.57 
 
 		 476 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.259034  normal  0.140596 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2869  alpha amylase catalytic region  30.71 
 
 		 578 aa  159  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2771  alpha amylase, catalytic region  29.66 
 
 		 433 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.473519  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  29.48 
 
 		 551 aa  158  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2815  alpha amylase, catalytic region  29.66 
 
 		 433 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.896664  normal  0.115274 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1431  alpha amylase catalytic region  26.23 
 
 		 663 aa  158  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.246388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  27.05 
 
 		 521 aa  158  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  28.78 
 
 		 815 aa  157  4e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  32.98 
 
 		 583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2798  alpha amylase, catalytic region  29.82 
 
 		 433 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.242606  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  29.27 
 
 		 585 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1167  alpha amylase catalytic region  31.31 
 
 		 576 aa  154  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.823071  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3705  alpha amylase catalytic region  31.16 
 
 		 617 aa  154  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00647332  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1114  alpha amylase catalytic subunit  30.56 
 
 		 580 aa  154  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0144434  normal  0.666267 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  29.66 
 
 		 600 aa  153  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  27.58 
 
 		 556 aa  153  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  31.07 
 
 		 654 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1458  alpha amylase, catalytic region  28.32 
 
 		 651 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  27.2 
 
 		 1753 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  30.02 
 
 		 558 aa  151  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1046  4-alpha-glucanotransferase  28.82 
 
 		 1145 aa  149  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  28.33 
 
 		 1094 aa  148  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4463  alpha amylase catalytic region  29.25 
 
 		 442 aa  148  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.469495 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1934  alpha amylase catalytic region  30 
 
 		 643 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>