54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1363 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1363  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1192    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5740  glycoside hydrolase clan GH-D  56.2 
 
 		 446 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0770281  normal  0.815155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2733  hypothetical protein  56.84 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3110  hypothetical protein  50.25 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.855481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0056  putative alpha-galactosidase  54.52 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29570  hypothetical protein  53.57 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0053  putative alpha-galactosidase  51.46 
 
 		 424 aa  377  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.961191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3249  glycoside hydrolase, clan GH-D  46.8 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3464  putative alpha-galactosidase  51.21 
 
 		 445 aa  353  4e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02790  hypothetical protein  50 
 
 		 442 aa  347  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2742  putative alpha-galactosidase  48.41 
 
 		 440 aa  342  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  normal  0.0185134 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1538  alpha-galactosidase  47.44 
 
 		 469 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0514  glycoside hydrolase, clan GH-D  47.34 
 
 		 435 aa  333  4e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000226064  decreased coverage  0.000231347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7223  glycoside hydrolase clan GH-D  32.4 
 
 		 583 aa  184  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  32.74 
 
 		 737 aa  161  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6874  Alpha-galactosidase  33.14 
 
 		 441 aa  154  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.817325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  34.99 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  29.93 
 
 		 589 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  32.39 
 
 		 532 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  30.17 
 
 		 604 aa  144  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1597  glycoside hydrolase clan GH-D  30.6 
 
 		 471 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.312648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  33.14 
 
 		 658 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2129  Alpha-galactosidase  30.87 
 
 		 407 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.064626  normal  0.32848 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1677  Alpha-galactosidase  31.06 
 
 		 408 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1187  Alpha-galactosidase  32.25 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000788687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2554  Carbohydrate binding family 6  30.66 
 
 		 612 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  30.61 
 
 		 535 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  31.99 
 
 		 548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3892  Alpha-galactosidase  32.87 
 
 		 387 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.77449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  32.85 
 
 		 568 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1593  ribosomal protein S32  29.27 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000015241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  29.62 
 
 		 535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  31.38 
 
 		 693 aa  127  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  31.79 
 
 		 567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  27.99 
 
 		 677 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4675  Alpha-galactosidase  28.94 
 
 		 541 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2597  Alpha-galactosidase  29.65 
 
 		 403 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.136605  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  30.41 
 
 		 597 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  28.07 
 
 		 558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2301  Alpha-galactosidase  27.75 
 
 		 399 aa  113  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  unclonable  0.000000654104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4439  Alpha-galactosidase  27.89 
 
 		 727 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4947  Alpha-galactosidase  27.59 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00219378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  27.51 
 
 		 547 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3450  Alpha-galactosidase  27.67 
 
 		 413 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2412  Alpha-galactosidase  28.06 
 
 		 631 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00268404  normal  0.284448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0313  Alpha-galactosidase  26.6 
 
 		 636 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  26.9 
 
 		 850 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00022  alpha-1,4-galactosidase (Eurofung)  25.94 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.917621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  25.5 
 
 		 574 aa  73.6  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4436  glucan 1,6-alpha-isomaltosidase  23.42 
 
 		 1172 aa  70.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07152  Alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR9]  23.73 
 
 		 640 aa  70.5  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0085  alpha-galactosidase  23.98 
 
 		 434 aa  67  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07624  Putative alpha-galactosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFR2]  23.51 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.17 
 
 		 1201 aa  48.5  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>