More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2106 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 471 aa  950    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1420  Outer membrane efflux protein  45.3 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2568  outer membrane efflux protein  44.67 
 
 		 438 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.316597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2553  outer membrane efflux protein  41.82 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1329  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  44.92 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2209  outer membrane efflux protein  37.62 
 
 		 433 aa  239  8e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.798472  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3970  Outer membrane efflux protein  36.71 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214282  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1847  outer membrane efflux protein  38.92 
 
 		 451 aa  237  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  36.93 
 
 		 418 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  36.93 
 
 		 418 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3557  outer membrane efflux protein  39.64 
 
 		 442 aa  232  9e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2433  outer membrane efflux protein  37.59 
 
 		 440 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6170  outer membrane efflux protein  39.45 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.446847 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1373  heavy metal resistance protein CzcC  38.14 
 
 		 443 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0705  RND heavy metal ion efflux pump, outer membrane protein  37.12 
 
 		 458 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.199067  normal  0.26582 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0491  cobalt-zinc-cadmium outer membrane resistance protein  39.11 
 
 		 441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31970  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  36.36 
 
 		 428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2715  outer membrane protein precursor CzcC  36.36 
 
 		 428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727923  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3677  outer membrane efflux protein  38.94 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4686  outer membrane efflux protein  38.94 
 
 		 439 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.432562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3845  outer membrane efflux protein  38.94 
 
 		 437 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4596  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin  37.99 
 
 		 431 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0688687  hitchhiker  0.005842 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2504  outer membrane efflux protein  39.74 
 
 		 436 aa  219  1e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10477  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  36.83 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1527  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC  41.93 
 
 		 452 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0399  heavy metal resistance protein CzcC  38.96 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.132876  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1031  heavy metal resistance protein CzcC  41.93 
 
 		 443 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.147927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0033  heavy metal resistance protein CzcC  41.93 
 
 		 443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1442  cobalt-zinc-cadmium resistance efflux protein  38.96 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0013  heavy metal resistance protein CzcC  38.96 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.238799  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1183  heavy metal resistance protein CzcC  38.96 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.84848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  35.84 
 
 		 444 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0617  outer membrane efflux protein  34.57 
 
 		 438 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  36.7 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3981  outer membrane efflux protein  34.92 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.377505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7266  putative outer membrane cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcC precursor  32.1 
 
 		 424 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217099  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  33.42 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  33.42 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  33.42 
 
 		 423 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  33.42 
 
 		 394 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4801  Outer membrane efflux protein  35.26 
 
 		 408 aa  190  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1714  outer membrane efflux protein  31.73 
 
 		 443 aa  189  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.664423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0377  metal ion efflux outer membrane protein, putative  34.41 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2042  outer membrane efflux protein  35.75 
 
 		 417 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3287  outer membrane efflux protein  35.07 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7183  putative outer membrane protein precursor CzcC  33.16 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2408  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcC, putative  35.44 
 
 		 425 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00195815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4530  outer membrane efflux protein  32.67 
 
 		 425 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2298  outer membrane efflux protein  29.53 
 
 		 423 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2142  outer membrane efflux protein  29.03 
 
 		 423 aa  169  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.143725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2344  outer membrane efflux protein  30.46 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3648  outer membrane efflux protein  30.79 
 
 		 424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.856557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1848  outer membrane efflux protein  30.37 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3343  outer membrane efflux protein  29.7 
 
 		 423 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.141208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1455  Outer membrane efflux protein  30.3 
 
 		 423 aa  151  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.170729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4156  outer membrane efflux protein  30.9 
 
 		 446 aa  146  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.283296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3870  Co/Zn/Cd efflux system component  29.06 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31040  putative cation efflux system protein  31.74 
 
 		 415 aa  141  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000919684  unclonable  5.14474e-22 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2321  outer membrane efflux protein  31.33 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.760032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02027  putative RND efflux system protein  26.32 
 
 		 413 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0665  outer membrane efflux protein  29.23 
 
 		 453 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000306808  hitchhiker  0.00231848 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1939  outer membrane efflux protein  28.6 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1957  putative RND efflux system protein  28.64 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2276  outer membrane efflux protein  29.22 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0693511 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3362  outer membrane efflux protein  27.93 
 
 		 431 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00372  putative RND efflux system protein  28.5 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0538  outer membrane efflux protein  26.79 
 
 		 432 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.355565  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0385  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1958  aconitate hydratase 1  27.84 
 
 		 422 aa  121  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0713794  normal  0.321859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3371  outer membrane efflux protein  27.59 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.252246  normal  0.409086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0502  outer membrane efflux protein  28.1 
 
 		 433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3455  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 449 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414344  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3997  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 427 aa  117  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2137  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  25.75 
 
 		 437 aa  114  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2029  outer membrane efflux protein  26.26 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.769975  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2097  Outer membrane efflux protein  26.7 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.771655  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3766  cation efflux system protein  26.46 
 
 		 415 aa  110  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2339  outer membrane efflux protein  27.72 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.884796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4386  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 		 427 aa  107  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.438421 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1044  HelC protein  22.34 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3398  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.93 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2284  outer membrane efflux protein  27.75 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185931  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2373  HelC protein  21.75 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0294  Outer membrane efflux protein  29.35 
 
 		 420 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2148  outer membrane efflux protein  26.53 
 
 		 400 aa  97.8  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08520  Outer membrane efflux protein  29.43 
 
 		 424 aa  96.7  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00307  Outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0828  metal ion efflux outer membrane protein family protein, putative  27.32 
 
 		 428 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2577  outer membrane efflux protein  29.22 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.996623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2567  outer membrane efflux protein  27.23 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2609  outer membrane efflux protein  27.42 
 
 		 425 aa  92.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0227  outer membrane efflux protein  25.37 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2356  RND OM export protein  29.7 
 
 		 421 aa  87.8  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1970  outer membrane efflux protein  25.91 
 
 		 414 aa  87  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0516  outer membrane efflux protein  26.04 
 
 		 413 aa  87  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1582  outer membrane efflux protein  25.26 
 
 		 523 aa  86.7  8e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2447  outer membrane efflux protein  27.99 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1176  Outer membrane efflux protein  28.07 
 
 		 429 aa  83.6  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2110  outer membrane efflux protein  22.47 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.313002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3507  Outer membrane efflux protein  24.1 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>