More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0746 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  81.38 
 
 		 378 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  60.14 
 
 		 716 aa  854    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 774 aa  1589    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  41.63 
 
 		 718 aa  516  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  42.22 
 
 		 730 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  38.47 
 
 		 750 aa  506  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  41.85 
 
 		 727 aa  505  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  40.3 
 
 		 742 aa  492  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  39.12 
 
 		 757 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  35.24 
 
 		 772 aa  417  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  33.53 
 
 		 727 aa  348  2e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  30.52 
 
 		 728 aa  313  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1610  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 733 aa  311  2.9999999999999997e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 		 728 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  28.51 
 
 		 726 aa  280  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  31.13 
 
 		 708 aa  278  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  28.69 
 
 		 727 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.88 
 
 		 727 aa  271  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 811 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 		 811 aa  262  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1560  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 714 aa  262  2e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.3619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  30.03 
 
 		 710 aa  256  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  28.89 
 
 		 729 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 710 aa  251  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  27.82 
 
 		 751 aa  248  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  28.3 
 
 		 710 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  27.26 
 
 		 743 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  29.37 
 
 		 742 aa  244  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 743 aa  242  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  27.58 
 
 		 743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  27.43 
 
 		 743 aa  240  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  28.97 
 
 		 744 aa  239  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 		 743 aa  238  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  31.25 
 
 		 722 aa  233  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  27.45 
 
 		 712 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  29.22 
 
 		 738 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  29.6 
 
 		 804 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 707 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  29.01 
 
 		 754 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 707 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  28.42 
 
 		 707 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  30.5 
 
 		 734 aa  225  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  27.11 
 
 		 706 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  29.45 
 
 		 804 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  26.69 
 
 		 724 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  26.84 
 
 		 704 aa  221  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 725 aa  220  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.02 
 
 		 724 aa  217  7e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  28.47 
 
 		 768 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  28.53 
 
 		 737 aa  215  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  29.54 
 
 		 804 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  28.87 
 
 		 771 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  25.51 
 
 		 719 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  27.46 
 
 		 753 aa  211  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  27.98 
 
 		 746 aa  210  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 737 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  27.96 
 
 		 808 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 		 755 aa  208  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  28.77 
 
 		 801 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  26.95 
 
 		 726 aa  207  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 772 aa  207  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 772 aa  207  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 731 aa  206  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 801 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  27.98 
 
 		 749 aa  205  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  28.38 
 
 		 800 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 685 aa  202  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 729 aa  201  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  28.15 
 
 		 730 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  27.69 
 
 		 756 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 712 aa  197  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.31 
 
 		 729 aa  196  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  27.64 
 
 		 715 aa  196  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  26.99 
 
 		 802 aa  196  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  26.84 
 
 		 722 aa  195  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  27.15 
 
 		 761 aa  194  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  26.55 
 
 		 761 aa  193  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  28.13 
 
 		 709 aa  192  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  26.93 
 
 		 729 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 		 823 aa  190  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1080  TonB dependent receptor  35.33 
 
 		 335 aa  190  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  27.12 
 
 		 730 aa  187  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 809 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 708 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  25.67 
 
 		 805 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 729 aa  185  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  25.78 
 
 		 705 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 728 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  28.88 
 
 		 879 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  26.64 
 
 		 700 aa  181  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 		 698 aa  181  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 		 728 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  27.01 
 
 		 777 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  27.37 
 
 		 762 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 839 aa  179  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  28.74 
 
 		 851 aa  178  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 753 aa  178  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  27.1 
 
 		 764 aa  178  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  28.53 
 
 		 773 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.109366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>