More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1080 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1080  TonB dependent receptor  100 
 
 
335 aa  682    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1560  TonB-dependent receptor  52.68 
 
 
714 aa  329  4e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.3619  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  48.82 
 
 
727 aa  318  7.999999999999999e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1610  TonB-dependent receptor  42.07 
 
 
733 aa  248  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  38.32 
 
 
730 aa  199  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  34.72 
 
 
378 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  37.69 
 
 
718 aa  192  8e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  35.33 
 
 
774 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  34.44 
 
 
716 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  36.39 
 
 
727 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 
742 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  36.2 
 
 
750 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  32.84 
 
 
757 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  31.72 
 
 
811 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  32.15 
 
 
811 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 
754 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 
772 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  28.35 
 
 
744 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  29.13 
 
 
712 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  31.23 
 
 
730 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 
731 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 
743 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  29.33 
 
 
804 aa  126  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  30.46 
 
 
743 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  28.36 
 
 
804 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  28.48 
 
 
746 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  28.62 
 
 
756 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 
729 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  31.68 
 
 
751 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  31.15 
 
 
801 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  28.73 
 
 
804 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  30.72 
 
 
771 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  28.57 
 
 
708 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  27.78 
 
 
729 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 
801 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 
800 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  25.48 
 
 
808 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  29.21 
 
 
761 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 
768 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 
753 aa  117  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 
764 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  30.33 
 
 
710 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  27.07 
 
 
753 aa  115  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  32.7 
 
 
724 aa  115  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 
743 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 
743 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 
743 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 
729 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 
749 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  29.62 
 
 
802 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  29.39 
 
 
743 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 
839 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  27.83 
 
 
851 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4013  TonB-dependent siderophore receptor  27.51 
 
 
879 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.302904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 
709 aa  113  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  34.91 
 
 
704 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 
710 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  26.74 
 
 
722 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  29.32 
 
 
722 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  27.25 
 
 
700 aa  109  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  27.06 
 
 
725 aa  109  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  28.52 
 
 
755 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  30.04 
 
 
758 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  27.09 
 
 
698 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 
777 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  29.8 
 
 
724 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 
734 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  28.9 
 
 
764 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  26.21 
 
 
823 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 
762 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  27.7 
 
 
712 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  28.75 
 
 
819 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 
773 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  30.12 
 
 
809 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 
728 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.57 
 
 
705 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  31.5 
 
 
719 aa  103  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 
805 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2669  putative ferric siderophore receptor protein precursor  27.35 
 
 
742 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765579  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  29.46 
 
 
737 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 
726 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 
728 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  31.7 
 
 
728 aa  99.8  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 
737 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 
772 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4403  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 
773 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.109366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  25.34 
 
 
727 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.08 
 
 
702 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  30.62 
 
 
772 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02105  hypothetical protein  29.23 
 
 
730 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  28 
 
 
710 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 
702 aa  95.9  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  26.62 
 
 
728 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 
724 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  23.63 
 
 
727 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  29.67 
 
 
726 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  26.12 
 
 
746 aa  93.2  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  26.04 
 
 
715 aa  93.2  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  31.8 
 
 
685 aa  92.8  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1714  TonB-dependent siderophore receptor  28.81 
 
 
729 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.666149  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>