More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5442 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  79.7 
 
 
810 aa  1274    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  92.33 
 
 
818 aa  1473    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  70.37 
 
 
830 aa  1070    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0494  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.11 
 
 
816 aa  839    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  54.85 
 
 
840 aa  883    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  70.63 
 
 
831 aa  1075    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  83.37 
 
 
816 aa  1321    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  68.25 
 
 
824 aa  1065    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  83.25 
 
 
816 aa  1318    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  70.63 
 
 
831 aa  1075    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  83.37 
 
 
816 aa  1321    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  70.03 
 
 
828 aa  1079    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
817 aa  1658    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  44.04 
 
 
830 aa  596  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  44.27 
 
 
693 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  43.59 
 
 
720 aa  511  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0707  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.89 
 
 
761 aa  508  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  35.49 
 
 
814 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  37.45 
 
 
726 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
801 aa  326  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 
819 aa  320  5e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  33.89 
 
 
880 aa  315  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  33.54 
 
 
871 aa  313  9e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
808 aa  312  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  34.05 
 
 
789 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.23 
 
 
695 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  33.67 
 
 
801 aa  307  5.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  31.95 
 
 
773 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
807 aa  296  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  33.29 
 
 
820 aa  295  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  34.71 
 
 
758 aa  291  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  35.29 
 
 
680 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  33.62 
 
 
744 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  31.96 
 
 
721 aa  284  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.1 
 
 
766 aa  283  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  33.23 
 
 
892 aa  281  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  32.64 
 
 
877 aa  279  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  36.13 
 
 
758 aa  276  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.53 
 
 
821 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  33.19 
 
 
740 aa  275  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  31.49 
 
 
784 aa  272  2e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.67 
 
 
705 aa  268  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  31.53 
 
 
821 aa  265  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  32.66 
 
 
739 aa  263  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.18 
 
 
747 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.57 
 
 
737 aa  254  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.5 
 
 
817 aa  250  6e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  30.59 
 
 
807 aa  248  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  33.99 
 
 
700 aa  241  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000948759 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.64 
 
 
763 aa  240  9e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 
736 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
703 aa  237  6e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  31.5 
 
 
1057 aa  233  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  31.3 
 
 
768 aa  232  3e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  28.33 
 
 
833 aa  226  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  31.69 
 
 
773 aa  225  3e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  29.84 
 
 
838 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 
710 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  29.66 
 
 
727 aa  221  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
710 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  30.6 
 
 
772 aa  217  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  30.24 
 
 
766 aa  215  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.56 
 
 
759 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  31.07 
 
 
750 aa  212  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  31.79 
 
 
722 aa  208  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.13 
 
 
761 aa  207  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.35 
 
 
727 aa  205  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  27.3 
 
 
806 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  29.17 
 
 
765 aa  201  6e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  28.91 
 
 
723 aa  199  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  29.94 
 
 
761 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  29.3 
 
 
771 aa  199  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
723 aa  197  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  31.47 
 
 
710 aa  195  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
1245 aa  194  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  27.93 
 
 
836 aa  193  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
695 aa  191  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.6 
 
 
859 aa  190  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  27.8 
 
 
765 aa  187  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  28.7 
 
 
880 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  28.94 
 
 
833 aa  186  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4526  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
1065 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  28.85 
 
 
817 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  27.11 
 
 
814 aa  184  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  27.72 
 
 
727 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  28.14 
 
 
776 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  29.1 
 
 
788 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  28.43 
 
 
710 aa  182  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  29.23 
 
 
720 aa  182  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  27.93 
 
 
648 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  28.1 
 
 
755 aa  181  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  30.61 
 
 
726 aa  180  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
831 aa  180  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  27.06 
 
 
727 aa  178  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  28.69 
 
 
808 aa  177  5e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  28.81 
 
 
788 aa  177  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  30.09 
 
 
732 aa  177  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  28.94 
 
 
741 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8542  membrane carboxypeptidase  28.15 
 
 
724 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.14 
 
 
764 aa  176  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>