More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0745 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 440 aa  891    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  55.42 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  54.48 
 
 		 429 aa  462  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  52.37 
 
 		 430 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  51.9 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  48.58 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  43.86 
 
 		 420 aa  332  8e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  42.96 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  39.9 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  40.18 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1473  diaminopimelate decarboxylase  40.09 
 
 		 436 aa  316  6e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0515  diaminopimelate decarboxylase  38.95 
 
 		 436 aa  315  9e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.843079  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  39.5 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  38.41 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  40.43 
 
 		 423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  40.8 
 
 		 434 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  38.35 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  41.09 
 
 		 416 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  41.12 
 
 		 437 aa  296  7e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  40.14 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  41.49 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  39.62 
 
 		 417 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  40.71 
 
 		 418 aa  290  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  37.7 
 
 		 417 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  40.94 
 
 		 416 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1204  diaminopimelate decarboxylase  41.18 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.313013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  39.15 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1364  diaminopimelate decarboxylase  41.08 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.844058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  38.97 
 
 		 445 aa  286  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000128402  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  39.81 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1130  diaminopimelate decarboxylase  39.01 
 
 		 447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.153124  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  39.53 
 
 		 416 aa  284  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  38.52 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  42.21 
 
 		 423 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  41.19 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  39.14 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  41.5 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  37.95 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  39.39 
 
 		 425 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1303  diaminopimelate decarboxylase  42.79 
 
 		 435 aa  280  5e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  39.81 
 
 		 421 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  40.75 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07140  diaminopimelate decarboxylase  39.11 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.993125  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  40.42 
 
 		 415 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  38.86 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  40.09 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  38.9 
 
 		 443 aa  277  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  40.65 
 
 		 415 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  41.97 
 
 		 414 aa  277  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  39.95 
 
 		 420 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  40.33 
 
 		 421 aa  277  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  41.49 
 
 		 425 aa  276  5e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  36.82 
 
 		 420 aa  276  6e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  38.55 
 
 		 420 aa  276  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  41.34 
 
 		 419 aa  276  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  41.34 
 
 		 419 aa  276  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2086  diaminopimelate decarboxylase  36.94 
 
 		 447 aa  276  7e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000557843  normal  0.888186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  41.08 
 
 		 423 aa  276  7e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  39.49 
 
 		 417 aa  275  8e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  41.08 
 
 		 423 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  38.88 
 
 		 431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3606  diaminopimelate decarboxylase  41.43 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00198954  hitchhiker  0.0000000450016 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  40.1 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2756  diaminopimelate decarboxylase  40.1 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303641  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3766  diaminopimelate decarboxylase  40.1 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3708  diaminopimelate decarboxylase  40.1 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  39.21 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3197  diaminopimelate decarboxylase  40.1 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1897  diaminopimelate decarboxylase  40.1 
 
 		 423 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  38.86 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  38.97 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  39.2 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  38.97 
 
 		 421 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  39.62 
 
 		 414 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  37.65 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  37.74 
 
 		 414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  40.52 
 
 		 422 aa  273  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3737  diaminopimelate decarboxylase  39.62 
 
 		 423 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  37.35 
 
 		 416 aa  273  6e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  38.64 
 
 		 431 aa  273  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  38.77 
 
 		 421 aa  272  9e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  41.61 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  38.64 
 
 		 431 aa  272  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  40.28 
 
 		 415 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  41.12 
 
 		 421 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3031  diaminopimelate decarboxylase  39.38 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  37.62 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  37 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3116  diaminopimelate decarboxylase  41.91 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  39.81 
 
 		 421 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  38.24 
 
 		 417 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  38.39 
 
 		 418 aa  269  7e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  39.21 
 
 		 432 aa  269  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  41.25 
 
 		 415 aa  269  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  40.05 
 
 		 421 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  40.28 
 
 		 421 aa  268  1e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  38.46 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  39.14 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  38.9 
 
 		 403 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  38.32 
 
 		 414 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>