More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1527 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1527  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 199 aa  409  1e-113  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.578611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  70.31 
 
 		 203 aa  295  4e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1336  isochorismatase hydrolase  63.5 
 
 		 204 aa  278  3e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175146  normal  0.297177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  59.16 
 
 		 196 aa  249  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  59.38 
 
 		 201 aa  238  5e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  58.55 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  54.08 
 
 		 214 aa  229  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  56.77 
 
 		 201 aa  214  5e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  59.02 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  43.75 
 
 		 193 aa  168  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0202  isochorismatase hydrolase  44.21 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00287334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  44.21 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2473  isochorismatase hydrolase  43.98 
 
 		 192 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0972  isochorismatase hydrolase  43.09 
 
 		 190 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  44.08 
 
 		 188 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0124  isochorismatase hydrolase  37.21 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.963178  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0073  isochorismatase hydrolase  41.18 
 
 		 176 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0637  isochorismatase hydrolase  35.67 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.553614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2603  isochorismatase hydrolase  34.48 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  35.88 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  36.97 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0460  isochorismatase hydrolase  37.42 
 
 		 174 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000118146  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0445  isochorismatase hydrolase  35.58 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000176183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2928  isochorismatase hydrolase  38.46 
 
 		 204 aa  97.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.820644 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22170  nicotinamidase-like amidase  31.63 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000776565  normal  0.0158237 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1085  amidase  37.11 
 
 		 181 aa  95.1  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5297  isochorismatase family protein  28.26 
 
 		 179 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000537015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2831  isochorismatase hydrolase  29.71 
 
 		 176 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 239 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  32.32 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  33.85 
 
 		 239 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  34.38 
 
 		 239 aa  92  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0021  isochorismatase family protein  27.72 
 
 		 179 aa  92  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00499035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  31.71 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  33.14 
 
 		 217 aa  91.7  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6045  isochorismatase hydrolase  34.46 
 
 		 329 aa  91.7  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  33.33 
 
 		 244 aa  91.3  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 		 205 aa  91.3  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0368  amidase  36.42 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  32.75 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  32.95 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  31.84 
 
 		 213 aa  89.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0023  isochorismatase family protein  27.17 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000151833  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  29.24 
 
 		 209 aa  89  4e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  31.28 
 
 		 248 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0016  isochorismatase hydrolase  27.72 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0019  isochorismatase family protein  27.17 
 
 		 179 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0016  isochorismatase family protein  27.17 
 
 		 179 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  27.17 
 
 		 179 aa  88.2  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0021  isochorismatase family protein  27.17 
 
 		 179 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3534  isochorismatase hydrolase  31.18 
 
 		 204 aa  87.8  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1454  isochorismatase family protein  31.29 
 
 		 184 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0526786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0017  isochorismatase family protein  27.32 
 
 		 179 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0209161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0017  nicotinamidase (pyrazinamidase)  27.72 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.382444  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0016  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0400295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0606  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3293  isochorismatase family protein  32.92 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  32.92 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  32.92 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  31.73 
 
 		 245 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30 
 
 		 231 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30 
 
 		 230 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30 
 
 		 231 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  32.18 
 
 		 246 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  32.91 
 
 		 188 aa  84.7  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  30.57 
 
 		 231 aa  84.7  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30 
 
 		 231 aa  84.3  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  29.5 
 
 		 231 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4541  isochorismatase hydrolase  29.35 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366879  normal  0.78546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  29.38 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0602  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3544  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3617  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.644685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3549  isochorismatase hydrolase  32.32 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  29.5 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3317  isochorismatase hydrolase  31.4 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0263  isochorismatase hydrolase  34.18 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1674  isochorismatase family protein  32.52 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000489002  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1079  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  29.5 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  27.6 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.66 
 
 		 230 aa  81.3  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  31.22 
 
 		 274 aa  81.3  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  29.36 
 
 		 233 aa  81.3  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1974  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  31.25 
 
 		 191 aa  80.9  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2008  isochorismatase hydrolase  30.91 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1614  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  31.58 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.57 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0871  isochorismatase hydrolase  32.7 
 
 		 178 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.317325  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3018  isochorismatase hydrolase  28 
 
 		 181 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2370  isochorismatase family protein  32.3 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.108087  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  30.64 
 
 		 533 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  30.65 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2800  isochorismatase hydrolase  32.3 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>