222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2185 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
148 aa  304  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0090  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
142 aa  110  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0096  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
142 aa  110  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  40.97 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0095  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
186 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 
186 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
186 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
186 aa  101  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2391  transcriptional regulator, MarR family protein  34.04 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.515688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3065  transcriptional regulator, MarR family protein  28.99 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2687  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.588117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
173 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 
141 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  25.35 
 
 
142 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  25.35 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  26.39 
 
 
160 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
160 aa  50.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 
158 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  27.84 
 
 
144 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  27.78 
 
 
161 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
163 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 
163 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0779  transcriptional regulator  37.04 
 
 
318 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.119696  normal  0.0560901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  25.2 
 
 
161 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  31.34 
 
 
154 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.7 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.7 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
150 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
303 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  20.34 
 
 
176 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
161 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
326 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
150 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
150 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
336 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
140 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  28.4 
 
 
160 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 
155 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0281  regulatory protein MarR  26.23 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  25.86 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5459  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.5362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2874  hypothetical protein  32.94 
 
 
313 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  30 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  28.21 
 
 
312 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
306 aa  46.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5296  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
337 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0928  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155001  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.52 
 
 
325 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4585  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
174 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 
139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  27.35 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  27.35 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 
140 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 
141 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  24.58 
 
 
140 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>