100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0375 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  100 
 
 		 964 aa  1952    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  47.08 
 
 		 977 aa  879    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  55.99 
 
 		 972 aa  1017    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  38.9 
 
 		 998 aa  608  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  41.88 
 
 		 244 aa  168  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  41.56 
 
 		 244 aa  168  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  42.24 
 
 		 244 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  39.83 
 
 		 243 aa  160  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  37.23 
 
 		 244 aa  155  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  39.83 
 
 		 244 aa  155  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  39.26 
 
 		 244 aa  154  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  35.98 
 
 		 241 aa  153  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  36.93 
 
 		 256 aa  153  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  40.52 
 
 		 244 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  41.41 
 
 		 244 aa  149  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 242 aa  146  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  28.35 
 
 		 891 aa  142  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  36.56 
 
 		 247 aa  138  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 		 247 aa  127  8.000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  37.5 
 
 		 240 aa  125  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  37.3 
 
 		 240 aa  125  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2068  ABC-type transport system protein involved in gliding motility auxiliary component-like protein  24.58 
 
 		 729 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.232799  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  28.63 
 
 		 244 aa  123  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  31.56 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 235 aa  117  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  33.88 
 
 		 242 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  36.52 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1768  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  24.71 
 
 		 508 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  30.77 
 
 		 248 aa  111  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 234 aa  108  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  40.51 
 
 		 234 aa  107  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  26.57 
 
 		 287 aa  107  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 235 aa  106  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  30.23 
 
 		 256 aa  106  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  37.39 
 
 		 235 aa  102  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  29.63 
 
 		 748 aa  97.8  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  35.8 
 
 		 242 aa  96.3  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  26.43 
 
 		 736 aa  94.4  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  25.1 
 
 		 235 aa  93.2  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  28.99 
 
 		 240 aa  91.3  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2608  ABC-type uncharacterized transport system  21.2 
 
 		 678 aa  89.7  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00018467  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  29.53 
 
 		 248 aa  89.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 768 aa  89.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  33.47 
 
 		 239 aa  85.9  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  30.08 
 
 		 251 aa  80.9  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  23.81 
 
 		 767 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  32.64 
 
 		 253 aa  76.6  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  30.77 
 
 		 260 aa  76.3  0.000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 		 242 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  31.05 
 
 		 770 aa  69.3  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3236  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component  24.15 
 
 		 559 aa  68.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0923144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  28.84 
 
 		 270 aa  66.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 261 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0220  hypothetical protein  23.44 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.447855 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  28.96 
 
 		 254 aa  60.8  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.59 
 
 		 244 aa  60.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11600  ABC transporter  26.64 
 
 		 600 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2721  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  23.1 
 
 		 561 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4905  gliding-associated putative ABC transporter substrate-binding component GldG  23.57 
 
 		 555 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16890  putative auxiliary component of ABC transporter  25.48 
 
 		 615 aa  58.9  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3719  gliding motility protein, ABC-related protein  23.7 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1469  hypothetical protein  25.48 
 
 		 614 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.662895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2907  hypothetical protein  33.88 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3142  hypothetical protein  31.3 
 
 		 626 aa  57.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39200  hypothetical protein  25 
 
 		 610 aa  56.2  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.320982  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08361  GldG  21.25 
 
 		 557 aa  55.8  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196642  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3071  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  31.58 
 
 		 610 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1547  gliding motility protein, ABC-related protein  20.96 
 
 		 557 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000436101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1399  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component protein  20.84 
 
 		 646 aa  53.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0779  hypothetical protein  21.46 
 
 		 502 aa  53.9  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2368  hypothetical protein  27.67 
 
 		 485 aa  53.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4185  hypothetical protein  30.43 
 
 		 643 aa  52.4  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1066  hypothetical protein  23.7 
 
 		 600 aa  52.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3358  putative ABC-2 type transport system permease protein  26.55 
 
 		 301 aa  52  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0148865  normal  0.0936569 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0005  hypothetical protein  27.19 
 
 		 523 aa  51.6  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0983  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like protein  31.53 
 
 		 462 aa  51.2  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  34.35 
 
 		 918 aa  50.8  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 267 aa  51.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0040  ABC-2 type transporter  24.22 
 
 		 313 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 		 378 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1563  hypothetical protein  29.23 
 
 		 622 aa  50.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.348161  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1753  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  22.47 
 
 		 481 aa  48.9  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  normal  0.0791157 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12990  hypothetical protein  25 
 
 		 498 aa  49.3  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.846752  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8101  ABC-2 type transporter  26.29 
 
 		 368 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  33.66 
 
 		 368 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3514  hypothetical protein  31.72 
 
 		 304 aa  48.5  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2112  hypothetical protein  26.02 
 
 		 495 aa  48.1  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  28.28 
 
 		 278 aa  46.6  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  31.71 
 
 		 384 aa  46.2  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28410  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  31.65 
 
 		 416 aa  46.6  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  28.91 
 
 		 382 aa  46.2  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  37.76 
 
 		 372 aa  45.8  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 		 387 aa  45.8  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  32.76 
 
 		 368 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0102  ABC-type uncharacterized transport system  25.37 
 
 		 542 aa  45.4  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.593442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1834  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.35 
 
 		 307 aa  45.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000279787  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 388 aa  44.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>