98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0042 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  607  1e-173  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  69.23 
 
 
321 aa  411  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  33.12 
 
 
378 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  32.18 
 
 
370 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  34.75 
 
 
320 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  33.02 
 
 
351 aa  162  6e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  31.07 
 
 
334 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  31.55 
 
 
386 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  24.35 
 
 
350 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  24.68 
 
 
328 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  24.73 
 
 
360 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  28.46 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
586 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  26.4 
 
 
334 aa  82.8  0.000000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  29.3 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  27.5 
 
 
326 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  26.81 
 
 
338 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  22.58 
 
 
346 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  22.49 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  23.99 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  24.91 
 
 
341 aa  75.5  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  23.24 
 
 
318 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  27.98 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  22.54 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  24.45 
 
 
342 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  24.18 
 
 
326 aa  72.4  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  23.64 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  24.37 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  22.19 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  26.19 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  23.16 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  30.6 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3833  integral membrane protein  25.99 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  24.33 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  30.6 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  24.23 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  26.83 
 
 
574 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  21.71 
 
 
347 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  23.42 
 
 
336 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  24.9 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  26.04 
 
 
344 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  22.07 
 
 
339 aa  63.2  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  19.31 
 
 
775 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  25.58 
 
 
346 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  27.89 
 
 
347 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  22.31 
 
 
339 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  32.03 
 
 
319 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  23.69 
 
 
309 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  26.17 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 
606 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  20.75 
 
 
344 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  19.05 
 
 
347 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  22.95 
 
 
338 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  24.73 
 
 
298 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1461  hypothetical protein  18.8 
 
 
346 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277531  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1386  hypothetical protein  29.6 
 
 
289 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  24.91 
 
 
339 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0199  hypothetical protein  24.85 
 
 
330 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.383692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1965  hypothetical protein  20.45 
 
 
320 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1100  hypothetical protein  28.28 
 
 
287 aa  52.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.629494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  23.55 
 
 
281 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0915  hypothetical membrane spanning protein  29.5 
 
 
349 aa  52.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127798  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  20.76 
 
 
328 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  24.38 
 
 
297 aa  52.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  20.76 
 
 
359 aa  52.8  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  25.23 
 
 
335 aa  52.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  25.09 
 
 
303 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  32.95 
 
 
391 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  25 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  28.47 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  22.97 
 
 
347 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  27.41 
 
 
321 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  17.92 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2416  hypothetical protein  24.73 
 
 
335 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0787706  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  21.86 
 
 
319 aa  47.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  24.53 
 
 
324 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 
613 aa  47  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1493  hypothetical protein  20.55 
 
 
347 aa  47  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  21.95 
 
 
314 aa  45.8  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1447  hypothetical protein  24.73 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.485556  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  28.18 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  22.63 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  27.21 
 
 
322 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0755  integral membrane protein-like protein  22.22 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0643382 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  21.02 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  21.49 
 
 
313 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  18.56 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  26.19 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  24.37 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1542  hypothetical protein  24.73 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.129792  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5211  hypothetical protein  23.78 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.719757  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  20.71 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  22.05 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  25.47 
 
 
335 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  27.27 
 
 
396 aa  43.5  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  30.26 
 
 
329 aa  43.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0105  hypothetical protein  25.2 
 
 
317 aa  42.7  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  24.44 
 
 
289 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>