63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4270 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3582  hypothetical protein  92.97 
 
 
378 aa  688    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  734    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  73.45 
 
 
351 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4436  hypothetical protein  49.46 
 
 
386 aa  319  5e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  40.43 
 
 
334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  36.68 
 
 
320 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  32.18 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  29.41 
 
 
321 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  26.6 
 
 
346 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  27.76 
 
 
350 aa  92.8  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
586 aa  90.9  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  28.29 
 
 
328 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  28.68 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  23.51 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  23.81 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  23.51 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  22.12 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  24.82 
 
 
574 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2300  hypothetical protein  27.85 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0170913  hitchhiker  0.00842153 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  24.84 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  21.64 
 
 
333 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1012  hypothetical protein  25.46 
 
 
323 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.58279 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  22.81 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1650  hypothetical protein  23.2 
 
 
339 aa  64.3  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2685  hypothetical protein  24.1 
 
 
342 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  22.71 
 
 
318 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  23.03 
 
 
336 aa  63.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  27.55 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1732  hypothetical protein  28.16 
 
 
281 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4079  hypothetical protein  28.08 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1082  hypothetical protein  22.37 
 
 
304 aa  57  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.789813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  23.93 
 
 
298 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  24.45 
 
 
322 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0521  hypothetical protein  25.33 
 
 
325 aa  53.9  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0481  hypothetical protein  26.99 
 
 
325 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1599  hypothetical protein  22.83 
 
 
319 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  25 
 
 
334 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1038  hypothetical protein  22.34 
 
 
341 aa  53.1  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2598  hypothetical protein  29.86 
 
 
340 aa  53.1  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.936976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0153  hypothetical protein  26.3 
 
 
326 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  34.29 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
613 aa  52.8  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2791  hypothetical protein  27.49 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1613  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  24.21 
 
 
775 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0160  hypothetical protein  30.19 
 
 
391 aa  50.4  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2850  hypothetical protein  27.5 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0981  hypothetical protein  25.81 
 
 
344 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4029  hypothetical protein  29.37 
 
 
326 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2516  hypothetical protein  22.08 
 
 
336 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.738603  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
606 aa  48.1  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4554  integral membrane protein  25.94 
 
 
346 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  33.33 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  25.32 
 
 
327 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6876  hypothetical protein  27.24 
 
 
344 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0782  hypothetical protein  25.32 
 
 
339 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1488  hypothetical protein  21.43 
 
 
329 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0444326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1791  hypothetical protein  25.36 
 
 
346 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0692  hypothetical protein  22.81 
 
 
326 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101924  normal  0.0824925 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3499  hypothetical protein  26.88 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140229  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01440  putative transmembrane protein  29.09 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3465  hypothetical protein  25.8 
 
 
350 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  25.73 
 
 
378 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0463  hypothetical protein  24.09 
 
 
288 aa  43.9  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>