33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3548 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3548  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00235957 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  60.37 
 
 
324 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0043  hypothetical protein  27.33 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274939  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  26.98 
 
 
340 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0163  hypothetical protein  25.38 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1657  hypothetical protein  23.13 
 
 
334 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2495  hypothetical protein  18.52 
 
 
297 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000133938  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0896  hypothetical protein  22.65 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  27.41 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3171  hypothetical protein  20.65 
 
 
346 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.208878  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  21.54 
 
 
333 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  27.68 
 
 
339 aa  53.5  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
586 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  25.81 
 
 
340 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  25 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  25 
 
 
321 aa  50.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  21.18 
 
 
318 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  21.55 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  26.12 
 
 
340 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2793  hypothetical protein  20.88 
 
 
360 aa  49.3  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  21.67 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1389  hypothetical protein  21.68 
 
 
336 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.718938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0089  hypothetical protein  25 
 
 
350 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0416134  normal  0.0758597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0178  hypothetical protein  24.22 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00230408  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3900  hypothetical protein  23.33 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3529  hypothetical protein  26.58 
 
 
327 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  23 
 
 
330 aa  46.2  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  24.08 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3446  hypothetical protein  28.87 
 
 
378 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.930769  normal  0.012517 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1628  hypothetical protein  24.22 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3135  hypothetical protein  26.7 
 
 
338 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  24.17 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3213  hypothetical protein  25.91 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0885433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>